Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Apol9bQ8C7I4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Apol9bQ8C7I4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Apol9bQ8C7I4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Apol9bQ8C7I4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Apol9bQ8C7I4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Apol9bQ8C7I4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Apol9bQ8C7I4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Apol9bQ8C7I4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Apol9bQ8C7I4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Apol9bQ8C7I4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Apol9bQ8C7I4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Apol9bQ8C7I4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Apol9bQ8C7I4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Apol9bQ8C7I4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Apol9bQ8C7I4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Apol9bQ8C7I4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Apol9bQ8C7I4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Apol9bQ8C7I4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Apol9bQ8C7I4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Apol9bQ8C7I4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Apol9bQ8C7I4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Apol9bQ8C7I4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Apol9bQ8C7I4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Apol9bQ8C7I4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Apol9bQ8C7I4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Apol9bQ8C7I4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Apol9bQ8C7I4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Apol9bQ8C7I4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Apol9bQ8C7I4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Apol9bQ8C7I4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Apol9bQ8C7I4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,72■■■□□ 2,19
Apol9bQ8C7I4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Apol9bQ8C7I4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Apol9bQ8C7I4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Apol9bQ8C7I4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Apol9bQ8C7I4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Apol9bQ8C7I4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Apol9bQ8C7I4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Apol9bQ8C7I4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Apol9bQ8C7I4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Apol9bQ8C7I4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Apol9bQ8C7I4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Apol9bQ8C7I4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Apol9bQ8C7I4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,54■■■□□ 2,16
Apol9bQ8C7I4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Apol9bQ8C7I4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Apol9bQ8C7I4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Apol9bQ8C7I4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Apol9bQ8C7I4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Apol9bQ8C7I4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Apol9bQ8C7I4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Apol9bQ8C7I4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Apol9bQ8C7I4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Apol9bQ8C7I4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Apol9bQ8C7I4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Apol9bQ8C7I4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Apol9bQ8C7I4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Apol9bQ8C7I4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Apol9bQ8C7I4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Apol9bQ8C7I4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Apol9bQ8C7I4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Apol9bQ8C7I4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Apol9bQ8C7I4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Apol9bQ8C7I4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Apol9bQ8C7I4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Apol9bQ8C7I4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Apol9bQ8C7I4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Apol9bQ8C7I4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Apol9bQ8C7I4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Apol9bQ8C7I4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Apol9bQ8C7I4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Apol9bQ8C7I4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Apol9bQ8C7I4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Apol9bQ8C7I4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Apol9bQ8C7I4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Apol9bQ8C7I4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Apol9bQ8C7I4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Apol9bQ8C7I4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Apol9bQ8C7I4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Apol9bQ8C7I4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Apol9bQ8C7I4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Apol9bQ8C7I4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Apol9bQ8C7I4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Apol9bQ8C7I4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Apol9bQ8C7I4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Apol9bQ8C7I4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Apol9bQ8C7I4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Apol9bQ8C7I4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Apol9bQ8C7I4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Apol9bQ8C7I4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Apol9bQ8C7I4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Apol9bQ8C7I4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
Apol9bQ8C7I4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Apol9bQ8C7I4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Apol9bQ8C7I4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Apol9bQ8C7I4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Apol9bQ8C7I4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Apol9bQ8C7I4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Apol9bQ8C7I4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,4 ms