Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim35Q8C006 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim35Q8C006 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim35Q8C006 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim35Q8C006 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim35Q8C006 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim35Q8C006 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim35Q8C006 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim35Q8C006 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim35Q8C006 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim35Q8C006 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim35Q8C006 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim35Q8C006 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim35Q8C006 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim35Q8C006 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim35Q8C006 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim35Q8C006 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim35Q8C006 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim35Q8C006 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim35Q8C006 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim35Q8C006 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim35Q8C006 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim35Q8C006 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim35Q8C006 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim35Q8C006 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim35Q8C006 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim35Q8C006 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim35Q8C006 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim35Q8C006 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim35Q8C006 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim35Q8C006 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim35Q8C006 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim35Q8C006 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim35Q8C006 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim35Q8C006 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim35Q8C006 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim35Q8C006 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim35Q8C006 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim35Q8C006 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim35Q8C006 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim35Q8C006 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim35Q8C006 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim35Q8C006 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim35Q8C006 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim35Q8C006 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim35Q8C006 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim35Q8C006 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim35Q8C006 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim35Q8C006 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim35Q8C006 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim35Q8C006 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim35Q8C006 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim35Q8C006 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim35Q8C006 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim35Q8C006 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim35Q8C006 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim35Q8C006 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim35Q8C006 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim35Q8C006 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim35Q8C006 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim35Q8C006 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim35Q8C006 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim35Q8C006 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim35Q8C006 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim35Q8C006 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim35Q8C006 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim35Q8C006 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim35Q8C006 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim35Q8C006 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim35Q8C006 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim35Q8C006 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim35Q8C006 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim35Q8C006 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim35Q8C006 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim35Q8C006 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim35Q8C006 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim35Q8C006 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim35Q8C006 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim35Q8C006 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim35Q8C006 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim35Q8C006 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim35Q8C006 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim35Q8C006 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim35Q8C006 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim35Q8C006 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim35Q8C006 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim35Q8C006 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim35Q8C006 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim35Q8C006 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim35Q8C006 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim35Q8C006 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim35Q8C006 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim35Q8C006 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim35Q8C006 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim35Q8C006 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim35Q8C006 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim35Q8C006 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim35Q8C006 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim35Q8C006 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim35Q8C006 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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