Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS3

Gbp9, Guanylate-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp9Q8BTS3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gbp9Q8BTS3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gbp9Q8BTS3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gbp9Q8BTS3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gbp9Q8BTS3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gbp9Q8BTS3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Gbp9Q8BTS3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gbp9Q8BTS3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gbp9Q8BTS3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gbp9Q8BTS3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gbp9Q8BTS3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gbp9Q8BTS3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gbp9Q8BTS3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gbp9Q8BTS3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gbp9Q8BTS3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gbp9Q8BTS3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gbp9Q8BTS3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gbp9Q8BTS3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gbp9Q8BTS3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gbp9Q8BTS3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gbp9Q8BTS3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gbp9Q8BTS3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gbp9Q8BTS3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gbp9Q8BTS3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gbp9Q8BTS3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gbp9Q8BTS3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gbp9Q8BTS3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gbp9Q8BTS3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gbp9Q8BTS3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gbp9Q8BTS3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gbp9Q8BTS3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gbp9Q8BTS3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gbp9Q8BTS3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gbp9Q8BTS3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gbp9Q8BTS3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gbp9Q8BTS3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gbp9Q8BTS3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gbp9Q8BTS3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Gbp9Q8BTS3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Gbp9Q8BTS3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gbp9Q8BTS3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gbp9Q8BTS3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gbp9Q8BTS3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gbp9Q8BTS3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gbp9Q8BTS3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gbp9Q8BTS3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gbp9Q8BTS3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gbp9Q8BTS3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gbp9Q8BTS3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gbp9Q8BTS3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gbp9Q8BTS3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gbp9Q8BTS3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gbp9Q8BTS3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gbp9Q8BTS3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gbp9Q8BTS3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gbp9Q8BTS3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Gbp9Q8BTS3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gbp9Q8BTS3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gbp9Q8BTS3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gbp9Q8BTS3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gbp9Q8BTS3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gbp9Q8BTS3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gbp9Q8BTS3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gbp9Q8BTS3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gbp9Q8BTS3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gbp9Q8BTS3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gbp9Q8BTS3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gbp9Q8BTS3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Gbp9Q8BTS3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gbp9Q8BTS3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gbp9Q8BTS3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gbp9Q8BTS3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Gbp9Q8BTS3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gbp9Q8BTS3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gbp9Q8BTS3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gbp9Q8BTS3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gbp9Q8BTS3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gbp9Q8BTS3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gbp9Q8BTS3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gbp9Q8BTS3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gbp9Q8BTS3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gbp9Q8BTS3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gbp9Q8BTS3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gbp9Q8BTS3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gbp9Q8BTS3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gbp9Q8BTS3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gbp9Q8BTS3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gbp9Q8BTS3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gbp9Q8BTS3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gbp9Q8BTS3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gbp9Q8BTS3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gbp9Q8BTS3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gbp9Q8BTS3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gbp9Q8BTS3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gbp9Q8BTS3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gbp9Q8BTS3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gbp9Q8BTS3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gbp9Q8BTS3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gbp9Q8BTS3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gbp9Q8BTS3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms