Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS3

Gbp9, Guanylate-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp9Q8BTS3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Gbp9Q8BTS3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Gbp9Q8BTS3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Gbp9Q8BTS3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Gbp9Q8BTS3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Gbp9Q8BTS3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
Gbp9Q8BTS3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Gbp9Q8BTS3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Gbp9Q8BTS3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Gbp9Q8BTS3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Gbp9Q8BTS3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Gbp9Q8BTS3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Gbp9Q8BTS3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Gbp9Q8BTS3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Gbp9Q8BTS3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Gbp9Q8BTS3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Gbp9Q8BTS3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Gbp9Q8BTS3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Gbp9Q8BTS3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Gbp9Q8BTS3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Gbp9Q8BTS3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Gbp9Q8BTS3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Gbp9Q8BTS3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Gbp9Q8BTS3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Gbp9Q8BTS3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Gbp9Q8BTS3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Gbp9Q8BTS3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Gbp9Q8BTS3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Gbp9Q8BTS3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Gbp9Q8BTS3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Gbp9Q8BTS3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Gbp9Q8BTS3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Gbp9Q8BTS3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Gbp9Q8BTS3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Gbp9Q8BTS3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Gbp9Q8BTS3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Gbp9Q8BTS3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Gbp9Q8BTS3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,84
Gbp9Q8BTS3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,57■■□□□ 1,84
Gbp9Q8BTS3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Gbp9Q8BTS3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Gbp9Q8BTS3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Gbp9Q8BTS3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Gbp9Q8BTS3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Gbp9Q8BTS3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Gbp9Q8BTS3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Gbp9Q8BTS3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Gbp9Q8BTS3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Gbp9Q8BTS3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Gbp9Q8BTS3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Gbp9Q8BTS3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Gbp9Q8BTS3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Gbp9Q8BTS3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Gbp9Q8BTS3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Gbp9Q8BTS3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Gbp9Q8BTS3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,33■■□□□ 1,81
Gbp9Q8BTS3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Gbp9Q8BTS3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Gbp9Q8BTS3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Gbp9Q8BTS3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Gbp9Q8BTS3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Gbp9Q8BTS3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Gbp9Q8BTS3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Gbp9Q8BTS3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Gbp9Q8BTS3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Gbp9Q8BTS3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Gbp9Q8BTS3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Gbp9Q8BTS3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,16■■□□□ 1,78
Gbp9Q8BTS3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Gbp9Q8BTS3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,14■■□□□ 1,77
Gbp9Q8BTS3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Gbp9Q8BTS3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,1■■□□□ 1,77
Gbp9Q8BTS3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Gbp9Q8BTS3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Gbp9Q8BTS3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Gbp9Q8BTS3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Gbp9Q8BTS3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Gbp9Q8BTS3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Gbp9Q8BTS3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Gbp9Q8BTS3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Gbp9Q8BTS3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Gbp9Q8BTS3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Gbp9Q8BTS3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Gbp9Q8BTS3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Gbp9Q8BTS3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Gbp9Q8BTS3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Gbp9Q8BTS3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Gbp9Q8BTS3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Gbp9Q8BTS3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Gbp9Q8BTS3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Gbp9Q8BTS3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Gbp9Q8BTS3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Gbp9Q8BTS3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
Gbp9Q8BTS3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Gbp9Q8BTS3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Gbp9Q8BTS3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Gbp9Q8BTS3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Gbp9Q8BTS3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Gbp9Q8BTS3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Gbp9Q8BTS3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms