Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMP6

Acbd3, Golgi resident protein GCP60, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd3Q8BMP6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Acbd3Q8BMP6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Acbd3Q8BMP6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Acbd3Q8BMP6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Acbd3Q8BMP6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Acbd3Q8BMP6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Acbd3Q8BMP6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Acbd3Q8BMP6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Acbd3Q8BMP6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Acbd3Q8BMP6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Acbd3Q8BMP6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Acbd3Q8BMP6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Acbd3Q8BMP6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Acbd3Q8BMP6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Acbd3Q8BMP6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Acbd3Q8BMP6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Acbd3Q8BMP6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Acbd3Q8BMP6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Acbd3Q8BMP6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Acbd3Q8BMP6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Acbd3Q8BMP6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Acbd3Q8BMP6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Acbd3Q8BMP6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Acbd3Q8BMP6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Acbd3Q8BMP6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Acbd3Q8BMP6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Acbd3Q8BMP6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Acbd3Q8BMP6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Acbd3Q8BMP6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Acbd3Q8BMP6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Acbd3Q8BMP6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Acbd3Q8BMP6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Acbd3Q8BMP6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Acbd3Q8BMP6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Acbd3Q8BMP6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Acbd3Q8BMP6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Acbd3Q8BMP6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Acbd3Q8BMP6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Acbd3Q8BMP6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Acbd3Q8BMP6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Acbd3Q8BMP6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Acbd3Q8BMP6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Acbd3Q8BMP6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Acbd3Q8BMP6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Acbd3Q8BMP6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Acbd3Q8BMP6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Acbd3Q8BMP6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Acbd3Q8BMP6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Acbd3Q8BMP6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Acbd3Q8BMP6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Acbd3Q8BMP6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Acbd3Q8BMP6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Acbd3Q8BMP6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Acbd3Q8BMP6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Acbd3Q8BMP6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Acbd3Q8BMP6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Acbd3Q8BMP6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Acbd3Q8BMP6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Acbd3Q8BMP6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Acbd3Q8BMP6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Acbd3Q8BMP6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Acbd3Q8BMP6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Acbd3Q8BMP6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Acbd3Q8BMP6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Acbd3Q8BMP6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Acbd3Q8BMP6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Acbd3Q8BMP6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Acbd3Q8BMP6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Acbd3Q8BMP6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Acbd3Q8BMP6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Acbd3Q8BMP6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Acbd3Q8BMP6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Acbd3Q8BMP6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Acbd3Q8BMP6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Acbd3Q8BMP6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Acbd3Q8BMP6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Acbd3Q8BMP6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Acbd3Q8BMP6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Acbd3Q8BMP6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Acbd3Q8BMP6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Acbd3Q8BMP6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Acbd3Q8BMP6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Acbd3Q8BMP6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Acbd3Q8BMP6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Acbd3Q8BMP6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Acbd3Q8BMP6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Acbd3Q8BMP6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Acbd3Q8BMP6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Acbd3Q8BMP6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Acbd3Q8BMP6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Acbd3Q8BMP6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Acbd3Q8BMP6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Acbd3Q8BMP6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Acbd3Q8BMP6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Acbd3Q8BMP6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Acbd3Q8BMP6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Acbd3Q8BMP6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Acbd3Q8BMP6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Acbd3Q8BMP6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Acbd3Q8BMP6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms