Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH24

Tm9sf4, Transmembrane 9 superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf4Q8BH24 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tm9sf4Q8BH24 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tm9sf4Q8BH24 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tm9sf4Q8BH24 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tm9sf4Q8BH24 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tm9sf4Q8BH24 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tm9sf4Q8BH24 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tm9sf4Q8BH24 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tm9sf4Q8BH24 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tm9sf4Q8BH24 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tm9sf4Q8BH24 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tm9sf4Q8BH24 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tm9sf4Q8BH24 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tm9sf4Q8BH24 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tm9sf4Q8BH24 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tm9sf4Q8BH24 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tm9sf4Q8BH24 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tm9sf4Q8BH24 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tm9sf4Q8BH24 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tm9sf4Q8BH24 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tm9sf4Q8BH24 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm9sf4Q8BH24 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm9sf4Q8BH24 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tm9sf4Q8BH24 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tm9sf4Q8BH24 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tm9sf4Q8BH24 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tm9sf4Q8BH24 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tm9sf4Q8BH24 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tm9sf4Q8BH24 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tm9sf4Q8BH24 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tm9sf4Q8BH24 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm9sf4Q8BH24 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm9sf4Q8BH24 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tm9sf4Q8BH24 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tm9sf4Q8BH24 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tm9sf4Q8BH24 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tm9sf4Q8BH24 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tm9sf4Q8BH24 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tm9sf4Q8BH24 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tm9sf4Q8BH24 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tm9sf4Q8BH24 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tm9sf4Q8BH24 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tm9sf4Q8BH24 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tm9sf4Q8BH24 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tm9sf4Q8BH24 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tm9sf4Q8BH24 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tm9sf4Q8BH24 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm9sf4Q8BH24 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm9sf4Q8BH24 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm9sf4Q8BH24 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm9sf4Q8BH24 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tm9sf4Q8BH24 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tm9sf4Q8BH24 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tm9sf4Q8BH24 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tm9sf4Q8BH24 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm9sf4Q8BH24 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tm9sf4Q8BH24 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm9sf4Q8BH24 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm9sf4Q8BH24 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tm9sf4Q8BH24 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tm9sf4Q8BH24 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tm9sf4Q8BH24 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tm9sf4Q8BH24 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tm9sf4Q8BH24 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tm9sf4Q8BH24 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tm9sf4Q8BH24 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tm9sf4Q8BH24 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tm9sf4Q8BH24 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tm9sf4Q8BH24 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tm9sf4Q8BH24 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tm9sf4Q8BH24 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tm9sf4Q8BH24 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tm9sf4Q8BH24 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm9sf4Q8BH24 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm9sf4Q8BH24 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm9sf4Q8BH24 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tm9sf4Q8BH24 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tm9sf4Q8BH24 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tm9sf4Q8BH24 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tm9sf4Q8BH24 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tm9sf4Q8BH24 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tm9sf4Q8BH24 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tm9sf4Q8BH24 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tm9sf4Q8BH24 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tm9sf4Q8BH24 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tm9sf4Q8BH24 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tm9sf4Q8BH24 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tm9sf4Q8BH24 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tm9sf4Q8BH24 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tm9sf4Q8BH24 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tm9sf4Q8BH24 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tm9sf4Q8BH24 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tm9sf4Q8BH24 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tm9sf4Q8BH24 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tm9sf4Q8BH24 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tm9sf4Q8BH24 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tm9sf4Q8BH24 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tm9sf4Q8BH24 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tm9sf4Q8BH24 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tm9sf4Q8BH24 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms