Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH02

Tor4a, Torsin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor4aQ8BH02 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tor4aQ8BH02 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tor4aQ8BH02 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Tor4aQ8BH02 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tor4aQ8BH02 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tor4aQ8BH02 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tor4aQ8BH02 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tor4aQ8BH02 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tor4aQ8BH02 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tor4aQ8BH02 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Tor4aQ8BH02 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tor4aQ8BH02 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Tor4aQ8BH02 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tor4aQ8BH02 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tor4aQ8BH02 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tor4aQ8BH02 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tor4aQ8BH02 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tor4aQ8BH02 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tor4aQ8BH02 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tor4aQ8BH02 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Tor4aQ8BH02 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tor4aQ8BH02 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tor4aQ8BH02 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tor4aQ8BH02 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tor4aQ8BH02 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tor4aQ8BH02 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tor4aQ8BH02 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Tor4aQ8BH02 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tor4aQ8BH02 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tor4aQ8BH02 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tor4aQ8BH02 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tor4aQ8BH02 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tor4aQ8BH02 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tor4aQ8BH02 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tor4aQ8BH02 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tor4aQ8BH02 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tor4aQ8BH02 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tor4aQ8BH02 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tor4aQ8BH02 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tor4aQ8BH02 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tor4aQ8BH02 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tor4aQ8BH02 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tor4aQ8BH02 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tor4aQ8BH02 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tor4aQ8BH02 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tor4aQ8BH02 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tor4aQ8BH02 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tor4aQ8BH02 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tor4aQ8BH02 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tor4aQ8BH02 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tor4aQ8BH02 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tor4aQ8BH02 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Tor4aQ8BH02 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tor4aQ8BH02 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tor4aQ8BH02 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tor4aQ8BH02 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tor4aQ8BH02 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tor4aQ8BH02 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tor4aQ8BH02 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tor4aQ8BH02 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tor4aQ8BH02 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Tor4aQ8BH02 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tor4aQ8BH02 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tor4aQ8BH02 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tor4aQ8BH02 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tor4aQ8BH02 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tor4aQ8BH02 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tor4aQ8BH02 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tor4aQ8BH02 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tor4aQ8BH02 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tor4aQ8BH02 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tor4aQ8BH02 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Tor4aQ8BH02 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tor4aQ8BH02 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tor4aQ8BH02 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tor4aQ8BH02 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tor4aQ8BH02 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tor4aQ8BH02 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tor4aQ8BH02 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tor4aQ8BH02 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tor4aQ8BH02 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tor4aQ8BH02 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tor4aQ8BH02 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tor4aQ8BH02 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tor4aQ8BH02 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tor4aQ8BH02 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Tor4aQ8BH02 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tor4aQ8BH02 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tor4aQ8BH02 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tor4aQ8BH02 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tor4aQ8BH02 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tor4aQ8BH02 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tor4aQ8BH02 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Tor4aQ8BH02 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Tor4aQ8BH02 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Tor4aQ8BH02 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tor4aQ8BH02 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tor4aQ8BH02 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tor4aQ8BH02 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tor4aQ8BH02 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms