Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Trim6Q8BGE7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Trim6Q8BGE7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Trim6Q8BGE7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Trim6Q8BGE7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Trim6Q8BGE7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Trim6Q8BGE7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Trim6Q8BGE7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Trim6Q8BGE7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Trim6Q8BGE7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Trim6Q8BGE7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Trim6Q8BGE7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Trim6Q8BGE7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Trim6Q8BGE7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Trim6Q8BGE7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Trim6Q8BGE7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Trim6Q8BGE7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Trim6Q8BGE7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Trim6Q8BGE7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Trim6Q8BGE7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Trim6Q8BGE7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Trim6Q8BGE7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Trim6Q8BGE7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Trim6Q8BGE7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Trim6Q8BGE7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Trim6Q8BGE7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Trim6Q8BGE7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Trim6Q8BGE7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Trim6Q8BGE7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Trim6Q8BGE7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Trim6Q8BGE7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Trim6Q8BGE7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Trim6Q8BGE7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Trim6Q8BGE7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Trim6Q8BGE7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Trim6Q8BGE7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Trim6Q8BGE7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Trim6Q8BGE7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Trim6Q8BGE7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Trim6Q8BGE7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Trim6Q8BGE7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Trim6Q8BGE7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Trim6Q8BGE7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Trim6Q8BGE7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Trim6Q8BGE7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Trim6Q8BGE7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Trim6Q8BGE7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Trim6Q8BGE7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
Trim6Q8BGE7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Trim6Q8BGE7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Trim6Q8BGE7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Trim6Q8BGE7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Trim6Q8BGE7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Trim6Q8BGE7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Trim6Q8BGE7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Trim6Q8BGE7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,83■■■□□ 2,05
Trim6Q8BGE7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Trim6Q8BGE7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Trim6Q8BGE7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Trim6Q8BGE7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Trim6Q8BGE7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Trim6Q8BGE7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Trim6Q8BGE7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
Trim6Q8BGE7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Trim6Q8BGE7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Trim6Q8BGE7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Trim6Q8BGE7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Trim6Q8BGE7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Trim6Q8BGE7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Trim6Q8BGE7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Trim6Q8BGE7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Trim6Q8BGE7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Trim6Q8BGE7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Trim6Q8BGE7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Trim6Q8BGE7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Trim6Q8BGE7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Trim6Q8BGE7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Trim6Q8BGE7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Trim6Q8BGE7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Trim6Q8BGE7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Trim6Q8BGE7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Trim6Q8BGE7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Trim6Q8BGE7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Trim6Q8BGE7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Trim6Q8BGE7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,56■■■□□ 2
Trim6Q8BGE7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Trim6Q8BGE7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Trim6Q8BGE7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Trim6Q8BGE7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Trim6Q8BGE7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Trim6Q8BGE7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Trim6Q8BGE7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Trim6Q8BGE7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Trim6Q8BGE7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Trim6Q8BGE7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Trim6Q8BGE7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Trim6Q8BGE7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Trim6Q8BGE7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Trim6Q8BGE7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Trim6Q8BGE7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
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