Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Amigo1Q80ZD8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Amigo1Q80ZD8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Amigo1Q80ZD8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Amigo1Q80ZD8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Amigo1Q80ZD8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Amigo1Q80ZD8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Amigo1Q80ZD8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Amigo1Q80ZD8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Amigo1Q80ZD8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Amigo1Q80ZD8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Amigo1Q80ZD8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Amigo1Q80ZD8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Amigo1Q80ZD8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Amigo1Q80ZD8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Amigo1Q80ZD8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Amigo1Q80ZD8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Amigo1Q80ZD8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Amigo1Q80ZD8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Amigo1Q80ZD8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Amigo1Q80ZD8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Amigo1Q80ZD8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Amigo1Q80ZD8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Amigo1Q80ZD8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Amigo1Q80ZD8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,85
Amigo1Q80ZD8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Amigo1Q80ZD8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Amigo1Q80ZD8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,52■■□□□ 1,84
Amigo1Q80ZD8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Amigo1Q80ZD8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Amigo1Q80ZD8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Amigo1Q80ZD8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Amigo1Q80ZD8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Amigo1Q80ZD8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Amigo1Q80ZD8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Amigo1Q80ZD8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26,39■■□□□ 1,82
Amigo1Q80ZD8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Amigo1Q80ZD8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Amigo1Q80ZD8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Amigo1Q80ZD8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,33■■□□□ 1,81
Amigo1Q80ZD8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Amigo1Q80ZD8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Amigo1Q80ZD8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Amigo1Q80ZD8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Amigo1Q80ZD8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Amigo1Q80ZD8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Amigo1Q80ZD8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Amigo1Q80ZD8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,22■■□□□ 1,79
Amigo1Q80ZD8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Amigo1Q80ZD8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Amigo1Q80ZD8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Amigo1Q80ZD8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,17■■□□□ 1,78
Amigo1Q80ZD8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Amigo1Q80ZD8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Amigo1Q80ZD8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,11■■□□□ 1,77
Amigo1Q80ZD8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Amigo1Q80ZD8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Amigo1Q80ZD8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Amigo1Q80ZD8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,07■■□□□ 1,76
Amigo1Q80ZD8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Amigo1Q80ZD8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Amigo1Q80ZD8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Amigo1Q80ZD8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Amigo1Q80ZD8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Amigo1Q80ZD8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Amigo1Q80ZD8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Amigo1Q80ZD8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Amigo1Q80ZD8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Amigo1Q80ZD8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Amigo1Q80ZD8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Amigo1Q80ZD8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Amigo1Q80ZD8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Amigo1Q80ZD8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Amigo1Q80ZD8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
Amigo1Q80ZD8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Amigo1Q80ZD8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Amigo1Q80ZD8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Amigo1Q80ZD8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,72
Amigo1Q80ZD8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Amigo1Q80ZD8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Amigo1Q80ZD8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Amigo1Q80ZD8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Amigo1Q80ZD8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Amigo1Q80ZD8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Amigo1Q80ZD8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Amigo1Q80ZD8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Amigo1Q80ZD8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Amigo1Q80ZD8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Amigo1Q80ZD8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Amigo1Q80ZD8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Amigo1Q80ZD8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Amigo1Q80ZD8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Amigo1Q80ZD8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
Amigo1Q80ZD8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Amigo1Q80ZD8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Amigo1Q80ZD8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Amigo1Q80ZD8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Amigo1Q80ZD8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
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