Protein–RNA interactions for Protein: Q80WT0

Jph4, Junctophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph4Q80WT0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
Jph4Q80WT0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Jph4Q80WT0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Jph4Q80WT0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Jph4Q80WT0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
Jph4Q80WT0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Jph4Q80WT0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Jph4Q80WT0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Jph4Q80WT0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Jph4Q80WT0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Jph4Q80WT0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Jph4Q80WT0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
Jph4Q80WT0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Jph4Q80WT0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
Jph4Q80WT0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Jph4Q80WT0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Jph4Q80WT0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Jph4Q80WT0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Jph4Q80WT0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Jph4Q80WT0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
Jph4Q80WT0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC44.04■■■■■ 4.64
Jph4Q80WT0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
Jph4Q80WT0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Jph4Q80WT0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Jph4Q80WT0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Jph4Q80WT0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Jph4Q80WT0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Jph4Q80WT0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Jph4Q80WT0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Jph4Q80WT0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
Jph4Q80WT0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Jph4Q80WT0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC43.75■■■■■ 4.59
Jph4Q80WT0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Jph4Q80WT0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Jph4Q80WT0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
Jph4Q80WT0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Jph4Q80WT0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Jph4Q80WT0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
Jph4Q80WT0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Jph4Q80WT0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Jph4Q80WT0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
Jph4Q80WT0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Jph4Q80WT0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
Jph4Q80WT0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Jph4Q80WT0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
Jph4Q80WT0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Jph4Q80WT0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Jph4Q80WT0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
Jph4Q80WT0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
Jph4Q80WT0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
Jph4Q80WT0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Jph4Q80WT0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Jph4Q80WT0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Jph4Q80WT0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Jph4Q80WT0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Jph4Q80WT0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC43.15■■■■■ 4.5
Jph4Q80WT0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
Jph4Q80WT0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Jph4Q80WT0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC43.07■■■■■ 4.49
Jph4Q80WT0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
Jph4Q80WT0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Jph4Q80WT0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
Jph4Q80WT0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Jph4Q80WT0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Jph4Q80WT0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
Jph4Q80WT0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Jph4Q80WT0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Jph4Q80WT0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
Jph4Q80WT0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
Jph4Q80WT0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
Jph4Q80WT0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Jph4Q80WT0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Jph4Q80WT0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Jph4Q80WT0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Jph4Q80WT0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Jph4Q80WT0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Jph4Q80WT0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Jph4Q80WT0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC42.69■■■■■ 4.42
Jph4Q80WT0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
Jph4Q80WT0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
Jph4Q80WT0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Jph4Q80WT0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
Jph4Q80WT0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.41
Jph4Q80WT0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Jph4Q80WT0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
Jph4Q80WT0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC42.6■■■■■ 4.41
Jph4Q80WT0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
Jph4Q80WT0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Jph4Q80WT0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Jph4Q80WT0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Jph4Q80WT0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Jph4Q80WT0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Jph4Q80WT0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Jph4Q80WT0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
Jph4Q80WT0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Jph4Q80WT0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Jph4Q80WT0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Jph4Q80WT0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Jph4Q80WT0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Jph4Q80WT0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2294.1 ms