Protein–RNA interactions for Protein: Q80WT0

Jph4, Junctophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph4Q80WT0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC44,61■■■■■ 4,73
Jph4Q80WT0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,56■■■■■ 4,72
Jph4Q80WT0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,52■■■■■ 4,72
Jph4Q80WT0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,5■■■■■ 4,71
Jph4Q80WT0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC44,44■■■■■ 4,7
Jph4Q80WT0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC44,42■■■■■ 4,7
Jph4Q80WT0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,4■■■■■ 4,7
Jph4Q80WT0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,33■■■■■ 4,69
Jph4Q80WT0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,27■■■■■ 4,68
Jph4Q80WT0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44,27■■■■■ 4,68
Jph4Q80WT0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,26■■■■■ 4,68
Jph4Q80WT0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,19■■■■■ 4,67
Jph4Q80WT0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,19■■■■■ 4,66
Jph4Q80WT0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC44,19■■■■■ 4,66
Jph4Q80WT0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,16■■■■■ 4,66
Jph4Q80WT0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC44,14■■■■■ 4,66
Jph4Q80WT0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,14■■■■■ 4,66
Jph4Q80WT0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC44,11■■■■■ 4,65
Jph4Q80WT0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,09■■■■■ 4,65
Jph4Q80WT0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC44,08■■■■■ 4,65
Jph4Q80WT0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC44,04■■■■■ 4,64
Jph4Q80WT0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC43,98■■■■■ 4,63
Jph4Q80WT0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC43,98■■■■■ 4,63
Jph4Q80WT0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC43,96■■■■■ 4,63
Jph4Q80WT0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,92■■■■■ 4,62
Jph4Q80WT0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,83■■■■■ 4,61
Jph4Q80WT0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,82■■■■■ 4,61
Jph4Q80WT0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC43,8■■■■■ 4,6
Jph4Q80WT0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC43,77■■■■■ 4,6
Jph4Q80WT0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC43,76■■■■■ 4,6
Jph4Q80WT0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,75■■■■■ 4,59
Jph4Q80WT0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC43,75■■■■■ 4,59
Jph4Q80WT0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,71■■■■■ 4,59
Jph4Q80WT0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC43,68■■■■■ 4,58
Jph4Q80WT0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC43,67■■■■■ 4,58
Jph4Q80WT0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,64■■■■■ 4,58
Jph4Q80WT0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,64■■■■■ 4,58
Jph4Q80WT0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC43,62■■■■■ 4,57
Jph4Q80WT0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,61■■■■■ 4,57
Jph4Q80WT0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,54■■■■■ 4,56
Jph4Q80WT0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,54■■■■■ 4,56
Jph4Q80WT0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC43,51■■■■■ 4,56
Jph4Q80WT0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC43,47■■■■■ 4,55
Jph4Q80WT0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC43,46■■■■■ 4,55
Jph4Q80WT0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC43,36■■■■■ 4,53
Jph4Q80WT0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC43,36■■■■■ 4,53
Jph4Q80WT0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC43,32■■■■■ 4,53
Jph4Q80WT0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,29■■■■■ 4,52
Jph4Q80WT0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC43,27■■■■■ 4,52
Jph4Q80WT0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC43,21■■■■■ 4,51
Jph4Q80WT0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43,2■■■■■ 4,51
Jph4Q80WT0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43,19■■■■■ 4,5
Jph4Q80WT0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,19■■■■■ 4,5
Jph4Q80WT0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,17■■■■■ 4,5
Jph4Q80WT0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43,15■■■■■ 4,5
Jph4Q80WT0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC43,15■■■■■ 4,5
Jph4Q80WT0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,13■■■■■ 4,49
Jph4Q80WT0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43,08■■■■■ 4,49
Jph4Q80WT0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC43,07■■■■■ 4,49
Jph4Q80WT0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC43,06■■■■■ 4,48
Jph4Q80WT0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,05■■■■■ 4,48
Jph4Q80WT0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43,05■■■■■ 4,48
Jph4Q80WT0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,03■■■■■ 4,48
Jph4Q80WT0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43,02■■■■■ 4,48
Jph4Q80WT0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC43,02■■■■■ 4,48
Jph4Q80WT0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,99■■■■■ 4,47
Jph4Q80WT0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,94■■■■■ 4,46
Jph4Q80WT0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC42,94■■■■■ 4,46
Jph4Q80WT0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,88■■■■■ 4,45
Jph4Q80WT0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42,87■■■■■ 4,45
Jph4Q80WT0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC42,85■■■■■ 4,45
Jph4Q80WT0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,83■■■■■ 4,45
Jph4Q80WT0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,83■■■■■ 4,45
Jph4Q80WT0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC42,82■■■■■ 4,45
Jph4Q80WT0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,81■■■■■ 4,44
Jph4Q80WT0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC42,8■■■■■ 4,44
Jph4Q80WT0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,7■■■■■ 4,43
Jph4Q80WT0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC42,69■■■■■ 4,42
Jph4Q80WT0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC42,68■■■■■ 4,42
Jph4Q80WT0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC42,67■■■■■ 4,42
Jph4Q80WT0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,64■■■■■ 4,42
Jph4Q80WT0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,63■■■■■ 4,42
Jph4Q80WT0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC42,63■■■■■ 4,41
Jph4Q80WT0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,63■■■■■ 4,41
Jph4Q80WT0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,62■■■■■ 4,41
Jph4Q80WT0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC42,6■■■■■ 4,41
Jph4Q80WT0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC42,57■■■■■ 4,41
Jph4Q80WT0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,56■■■■■ 4,4
Jph4Q80WT0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC42,51■■■■■ 4,4
Jph4Q80WT0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC42,48■■■■■ 4,39
Jph4Q80WT0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,46■■■■■ 4,39
Jph4Q80WT0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42,46■■■■■ 4,39
Jph4Q80WT0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC42,45■■■■■ 4,39
Jph4Q80WT0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC42,43■■■■■ 4,38
Jph4Q80WT0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC42,42■■■■■ 4,38
Jph4Q80WT0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,41■■■■■ 4,38
Jph4Q80WT0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,39■■■■■ 4,38
Jph4Q80WT0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,37■■■■■ 4,37
Jph4Q80WT0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,35■■■■■ 4,37
Jph4Q80WT0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,34■■■■■ 4,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms