Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Otop3Q80UF9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Otop3Q80UF9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32,81■■■□□ 2,84
Otop3Q80UF9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32,81■■■□□ 2,84
Otop3Q80UF9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Otop3Q80UF9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32,75■■■□□ 2,83
Otop3Q80UF9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Otop3Q80UF9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Otop3Q80UF9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Otop3Q80UF9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,72■■■□□ 2,83
Otop3Q80UF9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Otop3Q80UF9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Otop3Q80UF9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,67■■■□□ 2,82
Otop3Q80UF9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,62■■■□□ 2,81
Otop3Q80UF9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Otop3Q80UF9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,62■■■□□ 2,81
Otop3Q80UF9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32,6■■■□□ 2,81
Otop3Q80UF9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32,58■■■□□ 2,81
Otop3Q80UF9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Otop3Q80UF9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Otop3Q80UF9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32,51■■■□□ 2,79
Otop3Q80UF9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Otop3Q80UF9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Otop3Q80UF9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Otop3Q80UF9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Otop3Q80UF9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Otop3Q80UF9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Otop3Q80UF9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,77
Otop3Q80UF9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32,3■■■□□ 2,76
Otop3Q80UF9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Otop3Q80UF9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Otop3Q80UF9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Otop3Q80UF9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Otop3Q80UF9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Otop3Q80UF9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,12■■■□□ 2,73
Otop3Q80UF9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Otop3Q80UF9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,11■■■□□ 2,73
Otop3Q80UF9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32,08■■■□□ 2,73
Otop3Q80UF9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Otop3Q80UF9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Otop3Q80UF9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,05■■■□□ 2,72
Otop3Q80UF9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Otop3Q80UF9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32,03■■■□□ 2,72
Otop3Q80UF9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,01■■■□□ 2,71
Otop3Q80UF9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Otop3Q80UF9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31,98■■■□□ 2,71
Otop3Q80UF9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Otop3Q80UF9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Otop3Q80UF9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31,92■■■□□ 2,7
Otop3Q80UF9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31,89■■■□□ 2,7
Otop3Q80UF9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Otop3Q80UF9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31,85■■■□□ 2,69
Otop3Q80UF9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Otop3Q80UF9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Otop3Q80UF9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Otop3Q80UF9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Otop3Q80UF9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Otop3Q80UF9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Otop3Q80UF9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Otop3Q80UF9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31,62■■■□□ 2,65
Otop3Q80UF9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Otop3Q80UF9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Otop3Q80UF9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31,58■■■□□ 2,65
Otop3Q80UF9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Otop3Q80UF9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Otop3Q80UF9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Otop3Q80UF9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Otop3Q80UF9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Otop3Q80UF9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31,52■■■□□ 2,64
Otop3Q80UF9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,64
Otop3Q80UF9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Otop3Q80UF9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Otop3Q80UF9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Otop3Q80UF9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Otop3Q80UF9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Otop3Q80UF9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Otop3Q80UF9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Otop3Q80UF9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Otop3Q80UF9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Otop3Q80UF9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Otop3Q80UF9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Otop3Q80UF9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Otop3Q80UF9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31,34■■■□□ 2,61
Otop3Q80UF9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Otop3Q80UF9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Otop3Q80UF9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Otop3Q80UF9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Otop3Q80UF9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Otop3Q80UF9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Otop3Q80UF9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Otop3Q80UF9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Otop3Q80UF9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Otop3Q80UF9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Otop3Q80UF9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Otop3Q80UF9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Otop3Q80UF9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Otop3Q80UF9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Otop3Q80UF9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,57
Otop3Q80UF9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Otop3Q80UF9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms