Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37,12■■■■□ 3,53
Atf7ipQ7TT18 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Atf7ipQ7TT18 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,09■■■■□ 3,53
Atf7ipQ7TT18 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37,09■■■■□ 3,53
Atf7ipQ7TT18 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Atf7ipQ7TT18 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Atf7ipQ7TT18 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36,95■■■■□ 3,51
Atf7ipQ7TT18 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Atf7ipQ7TT18 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Atf7ipQ7TT18 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Atf7ipQ7TT18 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36,79■■■■□ 3,48
Atf7ipQ7TT18 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36,78■■■■□ 3,48
Atf7ipQ7TT18 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Atf7ipQ7TT18 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Atf7ipQ7TT18 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,72■■■■□ 3,47
Atf7ipQ7TT18 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Atf7ipQ7TT18 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Atf7ipQ7TT18 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Atf7ipQ7TT18 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36,65■■■■□ 3,46
Atf7ipQ7TT18 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Atf7ipQ7TT18 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,62■■■■□ 3,45
Atf7ipQ7TT18 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,44
Atf7ipQ7TT18 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Atf7ipQ7TT18 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,51■■■■□ 3,44
Atf7ipQ7TT18 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Atf7ipQ7TT18 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Atf7ipQ7TT18 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Atf7ipQ7TT18 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,42
Atf7ipQ7TT18 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36,43■■■■□ 3,42
Atf7ipQ7TT18 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Atf7ipQ7TT18 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Atf7ipQ7TT18 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36,39■■■■□ 3,42
Atf7ipQ7TT18 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Atf7ipQ7TT18 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Atf7ipQ7TT18 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Atf7ipQ7TT18 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36,26■■■■□ 3,39
Atf7ipQ7TT18 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Atf7ipQ7TT18 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Atf7ipQ7TT18 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,2■■■■□ 3,39
Atf7ipQ7TT18 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36,1■■■■□ 3,37
Atf7ipQ7TT18 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36,09■■■■□ 3,37
Atf7ipQ7TT18 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36,07■■■■□ 3,36
Atf7ipQ7TT18 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Atf7ipQ7TT18 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Atf7ipQ7TT18 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Atf7ipQ7TT18 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Atf7ipQ7TT18 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Atf7ipQ7TT18 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35,95■■■■□ 3,35
Atf7ipQ7TT18 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Atf7ipQ7TT18 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Atf7ipQ7TT18 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Atf7ipQ7TT18 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35,9■■■■□ 3,34
Atf7ipQ7TT18 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Atf7ipQ7TT18 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35,84■■■■□ 3,33
Atf7ipQ7TT18 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Atf7ipQ7TT18 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Atf7ipQ7TT18 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Atf7ipQ7TT18 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Atf7ipQ7TT18 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Atf7ipQ7TT18 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Atf7ipQ7TT18 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Atf7ipQ7TT18 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35,74■■■■□ 3,31
Atf7ipQ7TT18 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Atf7ipQ7TT18 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Atf7ipQ7TT18 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,67■■■■□ 3,3
Atf7ipQ7TT18 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35,66■■■■□ 3,3
Atf7ipQ7TT18 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35,65■■■■□ 3,3
Atf7ipQ7TT18 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Atf7ipQ7TT18 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Atf7ipQ7TT18 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Atf7ipQ7TT18 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35,59■■■■□ 3,29
Atf7ipQ7TT18 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Atf7ipQ7TT18 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,58■■■■□ 3,29
Atf7ipQ7TT18 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35,58■■■■□ 3,29
Atf7ipQ7TT18 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Atf7ipQ7TT18 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35,56■■■■□ 3,28
Atf7ipQ7TT18 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35,56■■■■□ 3,28
Atf7ipQ7TT18 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35,53■■■■□ 3,28
Atf7ipQ7TT18 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Atf7ipQ7TT18 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Atf7ipQ7TT18 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Atf7ipQ7TT18 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Atf7ipQ7TT18 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Atf7ipQ7TT18 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Atf7ipQ7TT18 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Atf7ipQ7TT18 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Atf7ipQ7TT18 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35,4■■■■□ 3,26
Atf7ipQ7TT18 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35,4■■■■□ 3,26
Atf7ipQ7TT18 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Atf7ipQ7TT18 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35,31■■■■□ 3,24
Atf7ipQ7TT18 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Atf7ipQ7TT18 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35,23■■■■□ 3,23
Atf7ipQ7TT18 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Atf7ipQ7TT18 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Atf7ipQ7TT18 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35,18■■■■□ 3,22
Atf7ipQ7TT18 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35,17■■■■□ 3,22
Atf7ipQ7TT18 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Atf7ipQ7TT18 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Atf7ipQ7TT18 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35,15■■■■□ 3,22
Atf7ipQ7TT18 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms