Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Tmc8Q7TN58 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Tmc8Q7TN58 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Tmc8Q7TN58 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
Tmc8Q7TN58 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Tmc8Q7TN58 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Tmc8Q7TN58 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Tmc8Q7TN58 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Tmc8Q7TN58 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Tmc8Q7TN58 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Tmc8Q7TN58 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Tmc8Q7TN58 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Tmc8Q7TN58 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Tmc8Q7TN58 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Tmc8Q7TN58 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,69■■■□□ 2,34
Tmc8Q7TN58 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,69■■■□□ 2,34
Tmc8Q7TN58 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Tmc8Q7TN58 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Tmc8Q7TN58 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Tmc8Q7TN58 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Tmc8Q7TN58 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Tmc8Q7TN58 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Tmc8Q7TN58 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Tmc8Q7TN58 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Tmc8Q7TN58 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Tmc8Q7TN58 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Tmc8Q7TN58 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Tmc8Q7TN58 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Tmc8Q7TN58 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Tmc8Q7TN58 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Tmc8Q7TN58 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Tmc8Q7TN58 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Tmc8Q7TN58 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Tmc8Q7TN58 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Tmc8Q7TN58 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Tmc8Q7TN58 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Tmc8Q7TN58 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Tmc8Q7TN58 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Tmc8Q7TN58 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Tmc8Q7TN58 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Tmc8Q7TN58 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Tmc8Q7TN58 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Tmc8Q7TN58 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Tmc8Q7TN58 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Tmc8Q7TN58 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Tmc8Q7TN58 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Tmc8Q7TN58 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Tmc8Q7TN58 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Tmc8Q7TN58 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,14■■■□□ 2,26
Tmc8Q7TN58 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Tmc8Q7TN58 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Tmc8Q7TN58 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Tmc8Q7TN58 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Tmc8Q7TN58 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Tmc8Q7TN58 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Tmc8Q7TN58 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Tmc8Q7TN58 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Tmc8Q7TN58 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Tmc8Q7TN58 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Tmc8Q7TN58 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Tmc8Q7TN58 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Tmc8Q7TN58 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Tmc8Q7TN58 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Tmc8Q7TN58 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Tmc8Q7TN58 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Tmc8Q7TN58 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Tmc8Q7TN58 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Tmc8Q7TN58 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Tmc8Q7TN58 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Tmc8Q7TN58 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Tmc8Q7TN58 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Tmc8Q7TN58 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Tmc8Q7TN58 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Tmc8Q7TN58 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Tmc8Q7TN58 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Tmc8Q7TN58 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28,72■■■□□ 2,19
Tmc8Q7TN58 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Tmc8Q7TN58 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Tmc8Q7TN58 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Tmc8Q7TN58 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Tmc8Q7TN58 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Tmc8Q7TN58 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Tmc8Q7TN58 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Tmc8Q7TN58 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Tmc8Q7TN58 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Tmc8Q7TN58 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,62■■■□□ 2,17
Tmc8Q7TN58 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tmc8Q7TN58 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Tmc8Q7TN58 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Tmc8Q7TN58 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Tmc8Q7TN58 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Tmc8Q7TN58 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
Tmc8Q7TN58 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tmc8Q7TN58 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Tmc8Q7TN58 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Tmc8Q7TN58 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Tmc8Q7TN58 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
Tmc8Q7TN58 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Tmc8Q7TN58 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Tmc8Q7TN58 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32,7 ms