Protein–RNA interactions for Protein: Q7M760

Zranb1, Ubiquitin thioesterase Zranb1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zranb1Q7M760 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Zranb1Q7M760 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Zranb1Q7M760 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Zranb1Q7M760 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Zranb1Q7M760 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Zranb1Q7M760 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Zranb1Q7M760 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Zranb1Q7M760 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Zranb1Q7M760 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Zranb1Q7M760 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Zranb1Q7M760 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Zranb1Q7M760 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Zranb1Q7M760 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Zranb1Q7M760 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Zranb1Q7M760 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Zranb1Q7M760 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Zranb1Q7M760 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Zranb1Q7M760 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Zranb1Q7M760 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Zranb1Q7M760 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Zranb1Q7M760 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Zranb1Q7M760 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
Zranb1Q7M760 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Zranb1Q7M760 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Zranb1Q7M760 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Zranb1Q7M760 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
Zranb1Q7M760 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Zranb1Q7M760 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Zranb1Q7M760 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Zranb1Q7M760 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Zranb1Q7M760 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Zranb1Q7M760 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Zranb1Q7M760 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Zranb1Q7M760 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Zranb1Q7M760 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Zranb1Q7M760 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Zranb1Q7M760 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Zranb1Q7M760 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Zranb1Q7M760 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Zranb1Q7M760 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Zranb1Q7M760 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Zranb1Q7M760 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Zranb1Q7M760 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Zranb1Q7M760 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Zranb1Q7M760 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Zranb1Q7M760 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Zranb1Q7M760 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Zranb1Q7M760 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Zranb1Q7M760 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Zranb1Q7M760 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Zranb1Q7M760 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Zranb1Q7M760 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Zranb1Q7M760 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Zranb1Q7M760 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Zranb1Q7M760 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Zranb1Q7M760 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Zranb1Q7M760 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Zranb1Q7M760 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Zranb1Q7M760 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Zranb1Q7M760 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Zranb1Q7M760 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Zranb1Q7M760 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Zranb1Q7M760 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Zranb1Q7M760 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Zranb1Q7M760 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Zranb1Q7M760 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Zranb1Q7M760 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Zranb1Q7M760 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Zranb1Q7M760 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Zranb1Q7M760 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Zranb1Q7M760 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Zranb1Q7M760 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Zranb1Q7M760 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Zranb1Q7M760 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Zranb1Q7M760 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Zranb1Q7M760 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Zranb1Q7M760 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Zranb1Q7M760 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Zranb1Q7M760 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Zranb1Q7M760 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Zranb1Q7M760 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Zranb1Q7M760 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Zranb1Q7M760 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Zranb1Q7M760 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Zranb1Q7M760 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Zranb1Q7M760 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Zranb1Q7M760 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Zranb1Q7M760 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Zranb1Q7M760 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Zranb1Q7M760 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Zranb1Q7M760 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Zranb1Q7M760 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Zranb1Q7M760 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Zranb1Q7M760 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Zranb1Q7M760 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Zranb1Q7M760 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Zranb1Q7M760 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Zranb1Q7M760 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Zranb1Q7M760 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Zranb1Q7M760 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms