Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ScocQ78YZ6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ScocQ78YZ6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScocQ78YZ6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScocQ78YZ6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScocQ78YZ6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ScocQ78YZ6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ScocQ78YZ6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ScocQ78YZ6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ScocQ78YZ6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ScocQ78YZ6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ScocQ78YZ6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ScocQ78YZ6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ScocQ78YZ6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ScocQ78YZ6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ScocQ78YZ6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ScocQ78YZ6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ScocQ78YZ6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ScocQ78YZ6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ScocQ78YZ6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ScocQ78YZ6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ScocQ78YZ6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ScocQ78YZ6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ScocQ78YZ6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ScocQ78YZ6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ScocQ78YZ6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ScocQ78YZ6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ScocQ78YZ6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ScocQ78YZ6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ScocQ78YZ6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ScocQ78YZ6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ScocQ78YZ6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ScocQ78YZ6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ScocQ78YZ6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ScocQ78YZ6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ScocQ78YZ6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ScocQ78YZ6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ScocQ78YZ6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ScocQ78YZ6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ScocQ78YZ6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ScocQ78YZ6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ScocQ78YZ6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ScocQ78YZ6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ScocQ78YZ6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ScocQ78YZ6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ScocQ78YZ6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ScocQ78YZ6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ScocQ78YZ6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ScocQ78YZ6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ScocQ78YZ6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ScocQ78YZ6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ScocQ78YZ6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ScocQ78YZ6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ScocQ78YZ6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ScocQ78YZ6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ScocQ78YZ6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ScocQ78YZ6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ScocQ78YZ6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ScocQ78YZ6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ScocQ78YZ6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ScocQ78YZ6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ScocQ78YZ6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ScocQ78YZ6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ScocQ78YZ6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ScocQ78YZ6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ScocQ78YZ6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ScocQ78YZ6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ScocQ78YZ6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScocQ78YZ6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScocQ78YZ6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ScocQ78YZ6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ScocQ78YZ6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ScocQ78YZ6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScocQ78YZ6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScocQ78YZ6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ScocQ78YZ6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScocQ78YZ6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScocQ78YZ6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ScocQ78YZ6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ScocQ78YZ6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScocQ78YZ6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScocQ78YZ6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScocQ78YZ6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScocQ78YZ6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ScocQ78YZ6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScocQ78YZ6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScocQ78YZ6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScocQ78YZ6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ScocQ78YZ6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ScocQ78YZ6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ScocQ78YZ6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScocQ78YZ6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScocQ78YZ6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ScocQ78YZ6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ScocQ78YZ6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ScocQ78YZ6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ScocQ78YZ6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ScocQ78YZ6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ScocQ78YZ6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ScocQ78YZ6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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