Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed3Q78IS1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed3Q78IS1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed3Q78IS1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmed3Q78IS1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmed3Q78IS1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmed3Q78IS1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed3Q78IS1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed3Q78IS1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed3Q78IS1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed3Q78IS1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed3Q78IS1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed3Q78IS1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed3Q78IS1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed3Q78IS1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed3Q78IS1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed3Q78IS1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed3Q78IS1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed3Q78IS1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed3Q78IS1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed3Q78IS1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed3Q78IS1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed3Q78IS1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed3Q78IS1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed3Q78IS1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed3Q78IS1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed3Q78IS1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed3Q78IS1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed3Q78IS1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmed3Q78IS1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmed3Q78IS1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed3Q78IS1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed3Q78IS1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed3Q78IS1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed3Q78IS1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed3Q78IS1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed3Q78IS1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed3Q78IS1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed3Q78IS1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed3Q78IS1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed3Q78IS1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed3Q78IS1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed3Q78IS1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed3Q78IS1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmed3Q78IS1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmed3Q78IS1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed3Q78IS1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed3Q78IS1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed3Q78IS1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed3Q78IS1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed3Q78IS1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed3Q78IS1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed3Q78IS1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed3Q78IS1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed3Q78IS1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed3Q78IS1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed3Q78IS1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed3Q78IS1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed3Q78IS1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmed3Q78IS1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed3Q78IS1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmed3Q78IS1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmed3Q78IS1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmed3Q78IS1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed3Q78IS1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed3Q78IS1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmed3Q78IS1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmed3Q78IS1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmed3Q78IS1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed3Q78IS1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmed3Q78IS1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmed3Q78IS1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed3Q78IS1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed3Q78IS1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmed3Q78IS1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmed3Q78IS1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmed3Q78IS1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed3Q78IS1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed3Q78IS1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed3Q78IS1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed3Q78IS1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed3Q78IS1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed3Q78IS1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed3Q78IS1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed3Q78IS1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed3Q78IS1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed3Q78IS1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tmed3Q78IS1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed3Q78IS1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed3Q78IS1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed3Q78IS1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed3Q78IS1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed3Q78IS1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmed3Q78IS1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmed3Q78IS1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmed3Q78IS1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmed3Q78IS1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmed3Q78IS1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmed3Q78IS1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmed3Q78IS1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms