Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
GypcQ78HU7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,53■■■□□ 2,64
GypcQ78HU7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
GypcQ78HU7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
GypcQ78HU7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31,48■■■□□ 2,63
GypcQ78HU7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,47■■■□□ 2,63
GypcQ78HU7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
GypcQ78HU7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
GypcQ78HU7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
GypcQ78HU7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
GypcQ78HU7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
GypcQ78HU7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
GypcQ78HU7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31,32■■■□□ 2,6
GypcQ78HU7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
GypcQ78HU7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31,28■■■□□ 2,6
GypcQ78HU7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
GypcQ78HU7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
GypcQ78HU7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31,26■■■□□ 2,59
GypcQ78HU7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
GypcQ78HU7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31,25■■■□□ 2,59
GypcQ78HU7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
GypcQ78HU7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,22■■■□□ 2,59
GypcQ78HU7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,21■■■□□ 2,59
GypcQ78HU7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,15■■■□□ 2,58
GypcQ78HU7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
GypcQ78HU7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
GypcQ78HU7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
GypcQ78HU7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
GypcQ78HU7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31,1■■■□□ 2,57
GypcQ78HU7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
GypcQ78HU7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
GypcQ78HU7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
GypcQ78HU7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
GypcQ78HU7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
GypcQ78HU7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,9■■■□□ 2,54
GypcQ78HU7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
GypcQ78HU7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
GypcQ78HU7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
GypcQ78HU7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
GypcQ78HU7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
GypcQ78HU7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,83■■■□□ 2,53
GypcQ78HU7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
GypcQ78HU7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,76■■■□□ 2,51
GypcQ78HU7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,73■■■□□ 2,51
GypcQ78HU7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,73■■■□□ 2,51
GypcQ78HU7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
GypcQ78HU7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
GypcQ78HU7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
GypcQ78HU7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,66■■■□□ 2,5
GypcQ78HU7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
GypcQ78HU7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
GypcQ78HU7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,6■■■□□ 2,49
GypcQ78HU7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,55■■■□□ 2,48
GypcQ78HU7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
GypcQ78HU7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
GypcQ78HU7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,48■■■□□ 2,47
GypcQ78HU7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,47■■■□□ 2,47
GypcQ78HU7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
GypcQ78HU7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
GypcQ78HU7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
GypcQ78HU7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
GypcQ78HU7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
GypcQ78HU7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
GypcQ78HU7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,36■■■□□ 2,45
GypcQ78HU7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
GypcQ78HU7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
GypcQ78HU7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
GypcQ78HU7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,31■■■□□ 2,44
GypcQ78HU7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
GypcQ78HU7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
GypcQ78HU7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
GypcQ78HU7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30,23■■■□□ 2,43
GypcQ78HU7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
GypcQ78HU7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
GypcQ78HU7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,22■■■□□ 2,43
GypcQ78HU7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
GypcQ78HU7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
GypcQ78HU7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
GypcQ78HU7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,21■■■□□ 2,43
GypcQ78HU7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
GypcQ78HU7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,16■■■□□ 2,42
GypcQ78HU7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,16■■■□□ 2,42
GypcQ78HU7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
GypcQ78HU7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
GypcQ78HU7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,1■■■□□ 2,41
GypcQ78HU7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
GypcQ78HU7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
GypcQ78HU7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
GypcQ78HU7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
GypcQ78HU7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
GypcQ78HU7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
GypcQ78HU7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
GypcQ78HU7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
GypcQ78HU7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
GypcQ78HU7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
GypcQ78HU7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
GypcQ78HU7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
GypcQ78HU7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
GypcQ78HU7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
GypcQ78HU7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
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