Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,72■■■□□ 2,51
Mindy1Q76LS9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Mindy1Q76LS9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Mindy1Q76LS9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Mindy1Q76LS9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Mindy1Q76LS9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Mindy1Q76LS9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Mindy1Q76LS9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Mindy1Q76LS9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Mindy1Q76LS9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Mindy1Q76LS9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Mindy1Q76LS9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Mindy1Q76LS9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Mindy1Q76LS9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Mindy1Q76LS9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Mindy1Q76LS9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Mindy1Q76LS9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Mindy1Q76LS9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Mindy1Q76LS9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Mindy1Q76LS9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Mindy1Q76LS9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Mindy1Q76LS9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Mindy1Q76LS9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Mindy1Q76LS9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Mindy1Q76LS9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Mindy1Q76LS9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Mindy1Q76LS9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Mindy1Q76LS9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Mindy1Q76LS9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Mindy1Q76LS9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Mindy1Q76LS9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Mindy1Q76LS9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Mindy1Q76LS9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Mindy1Q76LS9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Mindy1Q76LS9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Mindy1Q76LS9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Mindy1Q76LS9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Mindy1Q76LS9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Mindy1Q76LS9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Mindy1Q76LS9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Mindy1Q76LS9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Mindy1Q76LS9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Mindy1Q76LS9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Mindy1Q76LS9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Mindy1Q76LS9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Mindy1Q76LS9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Mindy1Q76LS9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,7■■■□□ 2,35
Mindy1Q76LS9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Mindy1Q76LS9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Mindy1Q76LS9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Mindy1Q76LS9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Mindy1Q76LS9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Mindy1Q76LS9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Mindy1Q76LS9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Mindy1Q76LS9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Mindy1Q76LS9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Mindy1Q76LS9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Mindy1Q76LS9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Mindy1Q76LS9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Mindy1Q76LS9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,49■■■□□ 2,31
Mindy1Q76LS9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Mindy1Q76LS9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
Mindy1Q76LS9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Mindy1Q76LS9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Mindy1Q76LS9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Mindy1Q76LS9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Mindy1Q76LS9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Mindy1Q76LS9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Mindy1Q76LS9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Mindy1Q76LS9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Mindy1Q76LS9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Mindy1Q76LS9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
Mindy1Q76LS9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Mindy1Q76LS9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Mindy1Q76LS9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Mindy1Q76LS9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Mindy1Q76LS9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Mindy1Q76LS9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Mindy1Q76LS9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Mindy1Q76LS9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Mindy1Q76LS9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Mindy1Q76LS9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Mindy1Q76LS9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Mindy1Q76LS9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Mindy1Q76LS9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Mindy1Q76LS9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Mindy1Q76LS9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Mindy1Q76LS9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Mindy1Q76LS9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Mindy1Q76LS9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Mindy1Q76LS9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Mindy1Q76LS9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Mindy1Q76LS9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Mindy1Q76LS9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Mindy1Q76LS9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Mindy1Q76LS9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Mindy1Q76LS9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Mindy1Q76LS9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Mindy1Q76LS9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Mindy1Q76LS9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms