Protein–RNA interactions for Protein: Q76KF0

Sema6d, Semaphorin-6D, mousemouse

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6dQ76KF0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema6dQ76KF0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema6dQ76KF0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema6dQ76KF0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema6dQ76KF0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema6dQ76KF0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema6dQ76KF0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema6dQ76KF0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema6dQ76KF0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema6dQ76KF0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema6dQ76KF0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema6dQ76KF0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema6dQ76KF0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema6dQ76KF0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema6dQ76KF0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema6dQ76KF0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6dQ76KF0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema6dQ76KF0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema6dQ76KF0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema6dQ76KF0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema6dQ76KF0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema6dQ76KF0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema6dQ76KF0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema6dQ76KF0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema6dQ76KF0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema6dQ76KF0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema6dQ76KF0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema6dQ76KF0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema6dQ76KF0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema6dQ76KF0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema6dQ76KF0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6dQ76KF0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6dQ76KF0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6dQ76KF0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6dQ76KF0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6dQ76KF0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6dQ76KF0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6dQ76KF0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema6dQ76KF0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema6dQ76KF0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema6dQ76KF0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6dQ76KF0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6dQ76KF0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6dQ76KF0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6dQ76KF0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema6dQ76KF0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6dQ76KF0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema6dQ76KF0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema6dQ76KF0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema6dQ76KF0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6dQ76KF0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6dQ76KF0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6dQ76KF0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema6dQ76KF0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema6dQ76KF0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6dQ76KF0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6dQ76KF0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema6dQ76KF0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6dQ76KF0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6dQ76KF0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6dQ76KF0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6dQ76KF0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema6dQ76KF0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6dQ76KF0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6dQ76KF0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema6dQ76KF0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema6dQ76KF0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6dQ76KF0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6dQ76KF0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema6dQ76KF0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema6dQ76KF0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema6dQ76KF0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema6dQ76KF0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema6dQ76KF0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6dQ76KF0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema6dQ76KF0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema6dQ76KF0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6dQ76KF0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6dQ76KF0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema6dQ76KF0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema6dQ76KF0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6dQ76KF0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6dQ76KF0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6dQ76KF0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6dQ76KF0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema6dQ76KF0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema6dQ76KF0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6dQ76KF0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6dQ76KF0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema6dQ76KF0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6dQ76KF0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6dQ76KF0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6dQ76KF0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema6dQ76KF0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema6dQ76KF0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6dQ76KF0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6dQ76KF0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6dQ76KF0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6dQ76KF0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6dQ76KF0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms