Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Igsf3Q6ZQA6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Igsf3Q6ZQA6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Igsf3Q6ZQA6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Igsf3Q6ZQA6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Igsf3Q6ZQA6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Igsf3Q6ZQA6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Igsf3Q6ZQA6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Igsf3Q6ZQA6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Igsf3Q6ZQA6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Igsf3Q6ZQA6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Igsf3Q6ZQA6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Igsf3Q6ZQA6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Igsf3Q6ZQA6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Igsf3Q6ZQA6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Igsf3Q6ZQA6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Igsf3Q6ZQA6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Igsf3Q6ZQA6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Igsf3Q6ZQA6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Igsf3Q6ZQA6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Igsf3Q6ZQA6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Igsf3Q6ZQA6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Igsf3Q6ZQA6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Igsf3Q6ZQA6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Igsf3Q6ZQA6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Igsf3Q6ZQA6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Igsf3Q6ZQA6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Igsf3Q6ZQA6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Igsf3Q6ZQA6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Igsf3Q6ZQA6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Igsf3Q6ZQA6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Igsf3Q6ZQA6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Igsf3Q6ZQA6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Igsf3Q6ZQA6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Igsf3Q6ZQA6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Igsf3Q6ZQA6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Igsf3Q6ZQA6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Igsf3Q6ZQA6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Igsf3Q6ZQA6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Igsf3Q6ZQA6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Igsf3Q6ZQA6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Igsf3Q6ZQA6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Igsf3Q6ZQA6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Igsf3Q6ZQA6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Igsf3Q6ZQA6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Igsf3Q6ZQA6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Igsf3Q6ZQA6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Igsf3Q6ZQA6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Igsf3Q6ZQA6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Igsf3Q6ZQA6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Igsf3Q6ZQA6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Igsf3Q6ZQA6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Igsf3Q6ZQA6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Igsf3Q6ZQA6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Igsf3Q6ZQA6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Igsf3Q6ZQA6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Igsf3Q6ZQA6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Igsf3Q6ZQA6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Igsf3Q6ZQA6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Igsf3Q6ZQA6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Igsf3Q6ZQA6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Igsf3Q6ZQA6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Igsf3Q6ZQA6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Igsf3Q6ZQA6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Igsf3Q6ZQA6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Igsf3Q6ZQA6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Igsf3Q6ZQA6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Igsf3Q6ZQA6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Igsf3Q6ZQA6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Igsf3Q6ZQA6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Igsf3Q6ZQA6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Igsf3Q6ZQA6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Igsf3Q6ZQA6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Igsf3Q6ZQA6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Igsf3Q6ZQA6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Igsf3Q6ZQA6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Igsf3Q6ZQA6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Igsf3Q6ZQA6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Igsf3Q6ZQA6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Igsf3Q6ZQA6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Igsf3Q6ZQA6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Igsf3Q6ZQA6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Igsf3Q6ZQA6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Igsf3Q6ZQA6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Igsf3Q6ZQA6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Igsf3Q6ZQA6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Igsf3Q6ZQA6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Igsf3Q6ZQA6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Igsf3Q6ZQA6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Igsf3Q6ZQA6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Igsf3Q6ZQA6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Igsf3Q6ZQA6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Igsf3Q6ZQA6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Igsf3Q6ZQA6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Igsf3Q6ZQA6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Igsf3Q6ZQA6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Igsf3Q6ZQA6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Igsf3Q6ZQA6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Igsf3Q6ZQA6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Igsf3Q6ZQA6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7 ms