Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Efr3bQ6ZQ18 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Efr3bQ6ZQ18 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Efr3bQ6ZQ18 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Efr3bQ6ZQ18 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Efr3bQ6ZQ18 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Efr3bQ6ZQ18 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Efr3bQ6ZQ18 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Efr3bQ6ZQ18 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Efr3bQ6ZQ18 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Efr3bQ6ZQ18 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Efr3bQ6ZQ18 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Efr3bQ6ZQ18 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Efr3bQ6ZQ18 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Efr3bQ6ZQ18 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Efr3bQ6ZQ18 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Efr3bQ6ZQ18 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Efr3bQ6ZQ18 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Efr3bQ6ZQ18 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Efr3bQ6ZQ18 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Efr3bQ6ZQ18 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Efr3bQ6ZQ18 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Efr3bQ6ZQ18 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Efr3bQ6ZQ18 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Efr3bQ6ZQ18 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Efr3bQ6ZQ18 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Efr3bQ6ZQ18 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Efr3bQ6ZQ18 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Efr3bQ6ZQ18 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Efr3bQ6ZQ18 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Efr3bQ6ZQ18 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Efr3bQ6ZQ18 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Efr3bQ6ZQ18 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Efr3bQ6ZQ18 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Efr3bQ6ZQ18 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Efr3bQ6ZQ18 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Efr3bQ6ZQ18 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Efr3bQ6ZQ18 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Efr3bQ6ZQ18 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Efr3bQ6ZQ18 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Efr3bQ6ZQ18 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Efr3bQ6ZQ18 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Efr3bQ6ZQ18 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Efr3bQ6ZQ18 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Efr3bQ6ZQ18 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Efr3bQ6ZQ18 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Efr3bQ6ZQ18 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Efr3bQ6ZQ18 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Efr3bQ6ZQ18 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Efr3bQ6ZQ18 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Efr3bQ6ZQ18 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Efr3bQ6ZQ18 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Efr3bQ6ZQ18 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Efr3bQ6ZQ18 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Efr3bQ6ZQ18 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Efr3bQ6ZQ18 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Efr3bQ6ZQ18 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Efr3bQ6ZQ18 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Efr3bQ6ZQ18 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Efr3bQ6ZQ18 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Efr3bQ6ZQ18 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Efr3bQ6ZQ18 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Efr3bQ6ZQ18 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Efr3bQ6ZQ18 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Efr3bQ6ZQ18 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efr3bQ6ZQ18 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Efr3bQ6ZQ18 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Efr3bQ6ZQ18 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Efr3bQ6ZQ18 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Efr3bQ6ZQ18 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Efr3bQ6ZQ18 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Efr3bQ6ZQ18 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Efr3bQ6ZQ18 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Efr3bQ6ZQ18 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Efr3bQ6ZQ18 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Efr3bQ6ZQ18 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Efr3bQ6ZQ18 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Efr3bQ6ZQ18 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Efr3bQ6ZQ18 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Efr3bQ6ZQ18 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Efr3bQ6ZQ18 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Efr3bQ6ZQ18 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Efr3bQ6ZQ18 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Efr3bQ6ZQ18 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Efr3bQ6ZQ18 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Efr3bQ6ZQ18 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Efr3bQ6ZQ18 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Efr3bQ6ZQ18 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Efr3bQ6ZQ18 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Efr3bQ6ZQ18 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Efr3bQ6ZQ18 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Efr3bQ6ZQ18 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Efr3bQ6ZQ18 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Efr3bQ6ZQ18 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efr3bQ6ZQ18 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efr3bQ6ZQ18 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efr3bQ6ZQ18 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Efr3bQ6ZQ18 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Efr3bQ6ZQ18 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Efr3bQ6ZQ18 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
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