Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc88cQ6VGS5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc88cQ6VGS5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc88cQ6VGS5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc88cQ6VGS5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc88cQ6VGS5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc88cQ6VGS5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc88cQ6VGS5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc88cQ6VGS5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc88cQ6VGS5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc88cQ6VGS5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc88cQ6VGS5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc88cQ6VGS5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc88cQ6VGS5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc88cQ6VGS5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc88cQ6VGS5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc88cQ6VGS5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc88cQ6VGS5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc88cQ6VGS5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc88cQ6VGS5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc88cQ6VGS5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc88cQ6VGS5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc88cQ6VGS5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc88cQ6VGS5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc88cQ6VGS5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc88cQ6VGS5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc88cQ6VGS5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc88cQ6VGS5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc88cQ6VGS5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc88cQ6VGS5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc88cQ6VGS5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc88cQ6VGS5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc88cQ6VGS5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc88cQ6VGS5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc88cQ6VGS5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc88cQ6VGS5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc88cQ6VGS5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc88cQ6VGS5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc88cQ6VGS5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc88cQ6VGS5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc88cQ6VGS5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc88cQ6VGS5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc88cQ6VGS5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc88cQ6VGS5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc88cQ6VGS5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc88cQ6VGS5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc88cQ6VGS5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc88cQ6VGS5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc88cQ6VGS5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc88cQ6VGS5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc88cQ6VGS5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc88cQ6VGS5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc88cQ6VGS5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc88cQ6VGS5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc88cQ6VGS5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc88cQ6VGS5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc88cQ6VGS5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc88cQ6VGS5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc88cQ6VGS5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc88cQ6VGS5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc88cQ6VGS5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms