Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Atp8b3Q6UQ17 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Atp8b3Q6UQ17 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Atp8b3Q6UQ17 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Atp8b3Q6UQ17 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Atp8b3Q6UQ17 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Atp8b3Q6UQ17 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Atp8b3Q6UQ17 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Atp8b3Q6UQ17 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Atp8b3Q6UQ17 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Atp8b3Q6UQ17 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Atp8b3Q6UQ17 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Atp8b3Q6UQ17 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Atp8b3Q6UQ17 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Atp8b3Q6UQ17 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Atp8b3Q6UQ17 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Atp8b3Q6UQ17 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Atp8b3Q6UQ17 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Atp8b3Q6UQ17 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Atp8b3Q6UQ17 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Atp8b3Q6UQ17 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Atp8b3Q6UQ17 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Atp8b3Q6UQ17 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Atp8b3Q6UQ17 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Atp8b3Q6UQ17 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Atp8b3Q6UQ17 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Atp8b3Q6UQ17 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Atp8b3Q6UQ17 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Atp8b3Q6UQ17 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Atp8b3Q6UQ17 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Atp8b3Q6UQ17 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Atp8b3Q6UQ17 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Atp8b3Q6UQ17 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Atp8b3Q6UQ17 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Atp8b3Q6UQ17 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Atp8b3Q6UQ17 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Atp8b3Q6UQ17 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Atp8b3Q6UQ17 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Atp8b3Q6UQ17 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Atp8b3Q6UQ17 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Atp8b3Q6UQ17 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Atp8b3Q6UQ17 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Atp8b3Q6UQ17 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Atp8b3Q6UQ17 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Atp8b3Q6UQ17 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Atp8b3Q6UQ17 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Atp8b3Q6UQ17 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Atp8b3Q6UQ17 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Atp8b3Q6UQ17 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Atp8b3Q6UQ17 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Atp8b3Q6UQ17 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Atp8b3Q6UQ17 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Atp8b3Q6UQ17 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Atp8b3Q6UQ17 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Atp8b3Q6UQ17 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Atp8b3Q6UQ17 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Atp8b3Q6UQ17 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Atp8b3Q6UQ17 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Atp8b3Q6UQ17 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Atp8b3Q6UQ17 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Atp8b3Q6UQ17 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Atp8b3Q6UQ17 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Atp8b3Q6UQ17 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Atp8b3Q6UQ17 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Atp8b3Q6UQ17 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Atp8b3Q6UQ17 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Atp8b3Q6UQ17 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Atp8b3Q6UQ17 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Atp8b3Q6UQ17 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Atp8b3Q6UQ17 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Atp8b3Q6UQ17 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Atp8b3Q6UQ17 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Atp8b3Q6UQ17 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Atp8b3Q6UQ17 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Atp8b3Q6UQ17 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Atp8b3Q6UQ17 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Atp8b3Q6UQ17 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Atp8b3Q6UQ17 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Atp8b3Q6UQ17 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Atp8b3Q6UQ17 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Atp8b3Q6UQ17 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Atp8b3Q6UQ17 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Atp8b3Q6UQ17 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Atp8b3Q6UQ17 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Atp8b3Q6UQ17 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Atp8b3Q6UQ17 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Atp8b3Q6UQ17 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Atp8b3Q6UQ17 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Atp8b3Q6UQ17 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Atp8b3Q6UQ17 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Atp8b3Q6UQ17 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms