Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sarm1Q6PDS3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sarm1Q6PDS3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sarm1Q6PDS3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sarm1Q6PDS3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sarm1Q6PDS3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sarm1Q6PDS3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sarm1Q6PDS3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sarm1Q6PDS3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sarm1Q6PDS3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sarm1Q6PDS3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sarm1Q6PDS3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sarm1Q6PDS3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sarm1Q6PDS3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sarm1Q6PDS3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sarm1Q6PDS3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sarm1Q6PDS3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sarm1Q6PDS3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sarm1Q6PDS3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sarm1Q6PDS3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sarm1Q6PDS3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sarm1Q6PDS3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sarm1Q6PDS3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sarm1Q6PDS3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sarm1Q6PDS3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sarm1Q6PDS3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sarm1Q6PDS3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sarm1Q6PDS3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Sarm1Q6PDS3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Sarm1Q6PDS3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sarm1Q6PDS3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sarm1Q6PDS3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sarm1Q6PDS3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sarm1Q6PDS3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sarm1Q6PDS3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sarm1Q6PDS3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sarm1Q6PDS3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sarm1Q6PDS3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sarm1Q6PDS3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sarm1Q6PDS3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sarm1Q6PDS3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sarm1Q6PDS3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sarm1Q6PDS3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sarm1Q6PDS3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sarm1Q6PDS3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sarm1Q6PDS3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sarm1Q6PDS3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sarm1Q6PDS3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sarm1Q6PDS3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sarm1Q6PDS3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sarm1Q6PDS3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sarm1Q6PDS3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sarm1Q6PDS3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sarm1Q6PDS3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sarm1Q6PDS3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Sarm1Q6PDS3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sarm1Q6PDS3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sarm1Q6PDS3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sarm1Q6PDS3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Sarm1Q6PDS3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sarm1Q6PDS3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sarm1Q6PDS3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Sarm1Q6PDS3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sarm1Q6PDS3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sarm1Q6PDS3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sarm1Q6PDS3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sarm1Q6PDS3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sarm1Q6PDS3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sarm1Q6PDS3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Sarm1Q6PDS3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sarm1Q6PDS3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sarm1Q6PDS3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sarm1Q6PDS3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sarm1Q6PDS3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sarm1Q6PDS3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sarm1Q6PDS3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sarm1Q6PDS3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sarm1Q6PDS3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sarm1Q6PDS3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sarm1Q6PDS3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sarm1Q6PDS3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sarm1Q6PDS3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sarm1Q6PDS3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sarm1Q6PDS3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sarm1Q6PDS3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sarm1Q6PDS3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sarm1Q6PDS3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sarm1Q6PDS3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sarm1Q6PDS3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sarm1Q6PDS3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sarm1Q6PDS3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sarm1Q6PDS3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Sarm1Q6PDS3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sarm1Q6PDS3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sarm1Q6PDS3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sarm1Q6PDS3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Sarm1Q6PDS3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sarm1Q6PDS3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sarm1Q6PDS3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sarm1Q6PDS3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms