Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL0

Bend3, BEN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend3Q6PAL0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Bend3Q6PAL0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Bend3Q6PAL0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35,08■■■■□ 3,21
Bend3Q6PAL0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35,06■■■■□ 3,2
Bend3Q6PAL0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Bend3Q6PAL0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Bend3Q6PAL0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,19
Bend3Q6PAL0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,98■■■■□ 3,19
Bend3Q6PAL0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,95■■■■□ 3,19
Bend3Q6PAL0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,18
Bend3Q6PAL0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Bend3Q6PAL0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34,87■■■■□ 3,17
Bend3Q6PAL0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Bend3Q6PAL0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Bend3Q6PAL0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,81■■■■□ 3,16
Bend3Q6PAL0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,8■■■■□ 3,16
Bend3Q6PAL0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Bend3Q6PAL0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Bend3Q6PAL0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,7■■■■□ 3,15
Bend3Q6PAL0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Bend3Q6PAL0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,69■■■■□ 3,14
Bend3Q6PAL0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34,65■■■■□ 3,14
Bend3Q6PAL0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Bend3Q6PAL0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Bend3Q6PAL0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34,58■■■■□ 3,13
Bend3Q6PAL0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,57■■■■□ 3,12
Bend3Q6PAL0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Bend3Q6PAL0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Bend3Q6PAL0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Bend3Q6PAL0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Bend3Q6PAL0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Bend3Q6PAL0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Bend3Q6PAL0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Bend3Q6PAL0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Bend3Q6PAL0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,32■■■■□ 3,08
Bend3Q6PAL0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,29■■■■□ 3,08
Bend3Q6PAL0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,28■■■■□ 3,08
Bend3Q6PAL0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Bend3Q6PAL0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Bend3Q6PAL0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,27■■■■□ 3,08
Bend3Q6PAL0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Bend3Q6PAL0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,22■■■■□ 3,07
Bend3Q6PAL0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Bend3Q6PAL0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Bend3Q6PAL0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Bend3Q6PAL0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Bend3Q6PAL0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Bend3Q6PAL0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34,11■■■■□ 3,05
Bend3Q6PAL0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Bend3Q6PAL0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,08■■■■□ 3,05
Bend3Q6PAL0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Bend3Q6PAL0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Bend3Q6PAL0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Bend3Q6PAL0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Bend3Q6PAL0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Bend3Q6PAL0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Bend3Q6PAL0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,82■■■■□ 3
Bend3Q6PAL0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,81■■■■□ 3
Bend3Q6PAL0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Bend3Q6PAL0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Bend3Q6PAL0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Bend3Q6PAL0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Bend3Q6PAL0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33,72■■■□□ 2,99
Bend3Q6PAL0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Bend3Q6PAL0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Bend3Q6PAL0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33,69■■■□□ 2,98
Bend3Q6PAL0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Bend3Q6PAL0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Bend3Q6PAL0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Bend3Q6PAL0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Bend3Q6PAL0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Bend3Q6PAL0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,64■■■□□ 2,98
Bend3Q6PAL0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Bend3Q6PAL0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Bend3Q6PAL0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Bend3Q6PAL0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33,55■■■□□ 2,96
Bend3Q6PAL0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Bend3Q6PAL0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Bend3Q6PAL0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Bend3Q6PAL0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33,48■■■□□ 2,95
Bend3Q6PAL0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Bend3Q6PAL0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Bend3Q6PAL0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Bend3Q6PAL0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Bend3Q6PAL0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Bend3Q6PAL0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Bend3Q6PAL0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Bend3Q6PAL0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Bend3Q6PAL0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Bend3Q6PAL0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Bend3Q6PAL0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Bend3Q6PAL0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Bend3Q6PAL0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Bend3Q6PAL0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,26■■■□□ 2,91
Bend3Q6PAL0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Bend3Q6PAL0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Bend3Q6PAL0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Bend3Q6PAL0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Bend3Q6PAL0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33,17■■■□□ 2,9
Bend3Q6PAL0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32,7 ms