Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx6Q6P8X1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snx6Q6P8X1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx6Q6P8X1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx6Q6P8X1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx6Q6P8X1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx6Q6P8X1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx6Q6P8X1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx6Q6P8X1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx6Q6P8X1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx6Q6P8X1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snx6Q6P8X1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snx6Q6P8X1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx6Q6P8X1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx6Q6P8X1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx6Q6P8X1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx6Q6P8X1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx6Q6P8X1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx6Q6P8X1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx6Q6P8X1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx6Q6P8X1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx6Q6P8X1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx6Q6P8X1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx6Q6P8X1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx6Q6P8X1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snx6Q6P8X1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx6Q6P8X1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx6Q6P8X1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snx6Q6P8X1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx6Q6P8X1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx6Q6P8X1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx6Q6P8X1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx6Q6P8X1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx6Q6P8X1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx6Q6P8X1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx6Q6P8X1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx6Q6P8X1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Snx6Q6P8X1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx6Q6P8X1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx6Q6P8X1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx6Q6P8X1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx6Q6P8X1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx6Q6P8X1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx6Q6P8X1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx6Q6P8X1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx6Q6P8X1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx6Q6P8X1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx6Q6P8X1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx6Q6P8X1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx6Q6P8X1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx6Q6P8X1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx6Q6P8X1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx6Q6P8X1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx6Q6P8X1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx6Q6P8X1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx6Q6P8X1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx6Q6P8X1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx6Q6P8X1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx6Q6P8X1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx6Q6P8X1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx6Q6P8X1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx6Q6P8X1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx6Q6P8X1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx6Q6P8X1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx6Q6P8X1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx6Q6P8X1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx6Q6P8X1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx6Q6P8X1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx6Q6P8X1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx6Q6P8X1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx6Q6P8X1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx6Q6P8X1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx6Q6P8X1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx6Q6P8X1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx6Q6P8X1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Snx6Q6P8X1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx6Q6P8X1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx6Q6P8X1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx6Q6P8X1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx6Q6P8X1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx6Q6P8X1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx6Q6P8X1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx6Q6P8X1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx6Q6P8X1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx6Q6P8X1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx6Q6P8X1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx6Q6P8X1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx6Q6P8X1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx6Q6P8X1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Snx6Q6P8X1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Snx6Q6P8X1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx6Q6P8X1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx6Q6P8X1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx6Q6P8X1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx6Q6P8X1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx6Q6P8X1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx6Q6P8X1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx6Q6P8X1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx6Q6P8X1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx6Q6P8X1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms