Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC061212Q6P8K3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BC061212Q6P8K3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC061212Q6P8K3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BC061212Q6P8K3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BC061212Q6P8K3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC061212Q6P8K3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC061212Q6P8K3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC061212Q6P8K3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BC061212Q6P8K3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BC061212Q6P8K3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BC061212Q6P8K3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BC061212Q6P8K3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC061212Q6P8K3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BC061212Q6P8K3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC061212Q6P8K3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BC061212Q6P8K3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC061212Q6P8K3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC061212Q6P8K3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC061212Q6P8K3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC061212Q6P8K3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC061212Q6P8K3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC061212Q6P8K3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC061212Q6P8K3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC061212Q6P8K3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC061212Q6P8K3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC061212Q6P8K3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BC061212Q6P8K3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC061212Q6P8K3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BC061212Q6P8K3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BC061212Q6P8K3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BC061212Q6P8K3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BC061212Q6P8K3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC061212Q6P8K3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BC061212Q6P8K3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC061212Q6P8K3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC061212Q6P8K3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC061212Q6P8K3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BC061212Q6P8K3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BC061212Q6P8K3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BC061212Q6P8K3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BC061212Q6P8K3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BC061212Q6P8K3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BC061212Q6P8K3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BC061212Q6P8K3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BC061212Q6P8K3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BC061212Q6P8K3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BC061212Q6P8K3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BC061212Q6P8K3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BC061212Q6P8K3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BC061212Q6P8K3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BC061212Q6P8K3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BC061212Q6P8K3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BC061212Q6P8K3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BC061212Q6P8K3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BC061212Q6P8K3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BC061212Q6P8K3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BC061212Q6P8K3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BC061212Q6P8K3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BC061212Q6P8K3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BC061212Q6P8K3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BC061212Q6P8K3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BC061212Q6P8K3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BC061212Q6P8K3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BC061212Q6P8K3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC061212Q6P8K3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BC061212Q6P8K3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC061212Q6P8K3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BC061212Q6P8K3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BC061212Q6P8K3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC061212Q6P8K3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC061212Q6P8K3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC061212Q6P8K3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC061212Q6P8K3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BC061212Q6P8K3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BC061212Q6P8K3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BC061212Q6P8K3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BC061212Q6P8K3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BC061212Q6P8K3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BC061212Q6P8K3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BC061212Q6P8K3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BC061212Q6P8K3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BC061212Q6P8K3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BC061212Q6P8K3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BC061212Q6P8K3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC061212Q6P8K3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC061212Q6P8K3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC061212Q6P8K3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC061212Q6P8K3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC061212Q6P8K3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC061212Q6P8K3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC061212Q6P8K3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC061212Q6P8K3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC061212Q6P8K3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC061212Q6P8K3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC061212Q6P8K3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC061212Q6P8K3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC061212Q6P8K3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BC061212Q6P8K3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BC061212Q6P8K3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms