Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H6

Frmd5, FERM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd5Q6P5H6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Frmd5Q6P5H6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Frmd5Q6P5H6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Frmd5Q6P5H6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Frmd5Q6P5H6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Frmd5Q6P5H6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Frmd5Q6P5H6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Frmd5Q6P5H6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Frmd5Q6P5H6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Frmd5Q6P5H6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Frmd5Q6P5H6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Frmd5Q6P5H6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Frmd5Q6P5H6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Frmd5Q6P5H6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Frmd5Q6P5H6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Frmd5Q6P5H6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Frmd5Q6P5H6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Frmd5Q6P5H6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Frmd5Q6P5H6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Frmd5Q6P5H6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Frmd5Q6P5H6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Frmd5Q6P5H6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Frmd5Q6P5H6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Frmd5Q6P5H6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Frmd5Q6P5H6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Frmd5Q6P5H6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Frmd5Q6P5H6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Frmd5Q6P5H6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Frmd5Q6P5H6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Frmd5Q6P5H6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Frmd5Q6P5H6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Frmd5Q6P5H6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Frmd5Q6P5H6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Frmd5Q6P5H6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Frmd5Q6P5H6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Frmd5Q6P5H6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Frmd5Q6P5H6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Frmd5Q6P5H6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Frmd5Q6P5H6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,11■■■□□ 2,25
Frmd5Q6P5H6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Frmd5Q6P5H6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Frmd5Q6P5H6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Frmd5Q6P5H6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Frmd5Q6P5H6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Frmd5Q6P5H6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Frmd5Q6P5H6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Frmd5Q6P5H6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Frmd5Q6P5H6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Frmd5Q6P5H6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Frmd5Q6P5H6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Frmd5Q6P5H6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Frmd5Q6P5H6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Frmd5Q6P5H6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Frmd5Q6P5H6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Frmd5Q6P5H6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,2
Frmd5Q6P5H6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,8■■■□□ 2,2
Frmd5Q6P5H6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Frmd5Q6P5H6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Frmd5Q6P5H6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Frmd5Q6P5H6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Frmd5Q6P5H6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Frmd5Q6P5H6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Frmd5Q6P5H6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Frmd5Q6P5H6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Frmd5Q6P5H6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Frmd5Q6P5H6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Frmd5Q6P5H6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Frmd5Q6P5H6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Frmd5Q6P5H6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Frmd5Q6P5H6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Frmd5Q6P5H6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Frmd5Q6P5H6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Frmd5Q6P5H6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Frmd5Q6P5H6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Frmd5Q6P5H6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
Frmd5Q6P5H6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Frmd5Q6P5H6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Frmd5Q6P5H6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,48■■■□□ 2,15
Frmd5Q6P5H6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Frmd5Q6P5H6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Frmd5Q6P5H6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Frmd5Q6P5H6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Frmd5Q6P5H6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Frmd5Q6P5H6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Frmd5Q6P5H6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Frmd5Q6P5H6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Frmd5Q6P5H6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Frmd5Q6P5H6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Frmd5Q6P5H6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Frmd5Q6P5H6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Frmd5Q6P5H6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Frmd5Q6P5H6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Frmd5Q6P5H6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Frmd5Q6P5H6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Frmd5Q6P5H6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Frmd5Q6P5H6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Frmd5Q6P5H6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Frmd5Q6P5H6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Frmd5Q6P5H6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Frmd5Q6P5H6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,4 ms