Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H6

Frmd5, FERM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd5Q6P5H6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Frmd5Q6P5H6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Frmd5Q6P5H6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Frmd5Q6P5H6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Frmd5Q6P5H6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Frmd5Q6P5H6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Frmd5Q6P5H6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Frmd5Q6P5H6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Frmd5Q6P5H6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Frmd5Q6P5H6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Frmd5Q6P5H6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Frmd5Q6P5H6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Frmd5Q6P5H6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Frmd5Q6P5H6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Frmd5Q6P5H6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Frmd5Q6P5H6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Frmd5Q6P5H6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Frmd5Q6P5H6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Frmd5Q6P5H6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Frmd5Q6P5H6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Frmd5Q6P5H6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Frmd5Q6P5H6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Frmd5Q6P5H6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Frmd5Q6P5H6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Frmd5Q6P5H6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Frmd5Q6P5H6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Frmd5Q6P5H6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Frmd5Q6P5H6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Frmd5Q6P5H6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Frmd5Q6P5H6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmd5Q6P5H6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmd5Q6P5H6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmd5Q6P5H6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Frmd5Q6P5H6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Frmd5Q6P5H6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Frmd5Q6P5H6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Frmd5Q6P5H6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Frmd5Q6P5H6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmd5Q6P5H6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmd5Q6P5H6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Frmd5Q6P5H6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Frmd5Q6P5H6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frmd5Q6P5H6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frmd5Q6P5H6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmd5Q6P5H6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmd5Q6P5H6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmd5Q6P5H6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Frmd5Q6P5H6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Frmd5Q6P5H6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Frmd5Q6P5H6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Frmd5Q6P5H6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Frmd5Q6P5H6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Frmd5Q6P5H6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Frmd5Q6P5H6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Frmd5Q6P5H6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Frmd5Q6P5H6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Frmd5Q6P5H6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Frmd5Q6P5H6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Frmd5Q6P5H6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Frmd5Q6P5H6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Frmd5Q6P5H6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Frmd5Q6P5H6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Frmd5Q6P5H6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Frmd5Q6P5H6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Frmd5Q6P5H6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Frmd5Q6P5H6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmd5Q6P5H6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Frmd5Q6P5H6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Frmd5Q6P5H6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Frmd5Q6P5H6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Frmd5Q6P5H6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Frmd5Q6P5H6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmd5Q6P5H6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmd5Q6P5H6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Frmd5Q6P5H6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Frmd5Q6P5H6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Frmd5Q6P5H6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Frmd5Q6P5H6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmd5Q6P5H6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frmd5Q6P5H6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Frmd5Q6P5H6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Frmd5Q6P5H6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Frmd5Q6P5H6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Frmd5Q6P5H6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Frmd5Q6P5H6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Frmd5Q6P5H6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Frmd5Q6P5H6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Frmd5Q6P5H6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Frmd5Q6P5H6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmd5Q6P5H6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmd5Q6P5H6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Frmd5Q6P5H6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Frmd5Q6P5H6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmd5Q6P5H6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmd5Q6P5H6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Frmd5Q6P5H6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Frmd5Q6P5H6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Frmd5Q6P5H6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Frmd5Q6P5H6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmd5Q6P5H6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms