Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Kdm2bQ6P1G2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37,62■■■■□ 3,61
Kdm2bQ6P1G2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37,59■■■■□ 3,61
Kdm2bQ6P1G2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,6
Kdm2bQ6P1G2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,56■■■■□ 3,6
Kdm2bQ6P1G2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Kdm2bQ6P1G2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37,55■■■■□ 3,6
Kdm2bQ6P1G2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Kdm2bQ6P1G2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC37,49■■■■□ 3,59
Kdm2bQ6P1G2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,46■■■■□ 3,59
Kdm2bQ6P1G2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Kdm2bQ6P1G2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37,42■■■■□ 3,58
Kdm2bQ6P1G2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37,4■■■■□ 3,58
Kdm2bQ6P1G2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37,35■■■■□ 3,57
Kdm2bQ6P1G2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC37,3■■■■□ 3,56
Kdm2bQ6P1G2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37,27■■■■□ 3,56
Kdm2bQ6P1G2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37,2■■■■□ 3,55
Kdm2bQ6P1G2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37,19■■■■□ 3,54
Kdm2bQ6P1G2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37,16■■■■□ 3,54
Kdm2bQ6P1G2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Kdm2bQ6P1G2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37,15■■■■□ 3,54
Kdm2bQ6P1G2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37,14■■■■□ 3,54
Kdm2bQ6P1G2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,54
Kdm2bQ6P1G2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Kdm2bQ6P1G2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Kdm2bQ6P1G2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC37,09■■■■□ 3,53
Kdm2bQ6P1G2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37,06■■■■□ 3,52
Kdm2bQ6P1G2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Kdm2bQ6P1G2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Kdm2bQ6P1G2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36,95■■■■□ 3,51
Kdm2bQ6P1G2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Kdm2bQ6P1G2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36,9■■■■□ 3,5
Kdm2bQ6P1G2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,89■■■■□ 3,5
Kdm2bQ6P1G2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,49
Kdm2bQ6P1G2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Kdm2bQ6P1G2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36,79■■■■□ 3,48
Kdm2bQ6P1G2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Kdm2bQ6P1G2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,47
Kdm2bQ6P1G2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36,73■■■■□ 3,47
Kdm2bQ6P1G2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Kdm2bQ6P1G2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
Kdm2bQ6P1G2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36,67■■■■□ 3,46
Kdm2bQ6P1G2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Kdm2bQ6P1G2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36,66■■■■□ 3,46
Kdm2bQ6P1G2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
Kdm2bQ6P1G2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Kdm2bQ6P1G2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Kdm2bQ6P1G2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC36,56■■■■□ 3,44
Kdm2bQ6P1G2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,55■■■■□ 3,44
Kdm2bQ6P1G2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36,5■■■■□ 3,43
Kdm2bQ6P1G2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Kdm2bQ6P1G2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36,46■■■■□ 3,43
Kdm2bQ6P1G2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC36,45■■■■□ 3,42
Kdm2bQ6P1G2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,39■■■■□ 3,42
Kdm2bQ6P1G2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Kdm2bQ6P1G2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Kdm2bQ6P1G2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,36■■■■□ 3,41
Kdm2bQ6P1G2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Kdm2bQ6P1G2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Kdm2bQ6P1G2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Kdm2bQ6P1G2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Kdm2bQ6P1G2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Kdm2bQ6P1G2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Kdm2bQ6P1G2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Kdm2bQ6P1G2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Kdm2bQ6P1G2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36,25■■■■□ 3,39
Kdm2bQ6P1G2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Kdm2bQ6P1G2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,22■■■■□ 3,39
Kdm2bQ6P1G2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Kdm2bQ6P1G2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
Kdm2bQ6P1G2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Kdm2bQ6P1G2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Kdm2bQ6P1G2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36,14■■■■□ 3,38
Kdm2bQ6P1G2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Kdm2bQ6P1G2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Kdm2bQ6P1G2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36,12■■■■□ 3,37
Kdm2bQ6P1G2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Kdm2bQ6P1G2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36,1■■■■□ 3,37
Kdm2bQ6P1G2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36,09■■■■□ 3,37
Kdm2bQ6P1G2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Kdm2bQ6P1G2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Kdm2bQ6P1G2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36,06■■■■□ 3,36
Kdm2bQ6P1G2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,03■■■■□ 3,36
Kdm2bQ6P1G2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36,01■■■■□ 3,35
Kdm2bQ6P1G2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3,35
Kdm2bQ6P1G2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC36■■■■□ 3,35
Kdm2bQ6P1G2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Kdm2bQ6P1G2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Kdm2bQ6P1G2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Kdm2bQ6P1G2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC35,95■■■■□ 3,35
Kdm2bQ6P1G2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Kdm2bQ6P1G2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Kdm2bQ6P1G2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Kdm2bQ6P1G2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Kdm2bQ6P1G2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35,88■■■■□ 3,33
Kdm2bQ6P1G2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Kdm2bQ6P1G2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Kdm2bQ6P1G2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Kdm2bQ6P1G2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Kdm2bQ6P1G2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35,79■■■■□ 3,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,6 ms