Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL8

Scube1, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube1Q6NZL8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scube1Q6NZL8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scube1Q6NZL8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scube1Q6NZL8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scube1Q6NZL8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scube1Q6NZL8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scube1Q6NZL8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scube1Q6NZL8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Scube1Q6NZL8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scube1Q6NZL8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scube1Q6NZL8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Scube1Q6NZL8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scube1Q6NZL8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scube1Q6NZL8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scube1Q6NZL8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scube1Q6NZL8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scube1Q6NZL8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scube1Q6NZL8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scube1Q6NZL8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Scube1Q6NZL8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scube1Q6NZL8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scube1Q6NZL8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Scube1Q6NZL8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scube1Q6NZL8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scube1Q6NZL8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scube1Q6NZL8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scube1Q6NZL8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scube1Q6NZL8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scube1Q6NZL8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scube1Q6NZL8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scube1Q6NZL8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scube1Q6NZL8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Scube1Q6NZL8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scube1Q6NZL8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scube1Q6NZL8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scube1Q6NZL8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scube1Q6NZL8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scube1Q6NZL8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Scube1Q6NZL8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scube1Q6NZL8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scube1Q6NZL8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scube1Q6NZL8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scube1Q6NZL8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scube1Q6NZL8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scube1Q6NZL8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scube1Q6NZL8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scube1Q6NZL8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scube1Q6NZL8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scube1Q6NZL8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scube1Q6NZL8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scube1Q6NZL8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scube1Q6NZL8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scube1Q6NZL8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scube1Q6NZL8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scube1Q6NZL8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scube1Q6NZL8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scube1Q6NZL8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scube1Q6NZL8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scube1Q6NZL8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scube1Q6NZL8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scube1Q6NZL8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scube1Q6NZL8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Scube1Q6NZL8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Scube1Q6NZL8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scube1Q6NZL8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scube1Q6NZL8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Scube1Q6NZL8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Scube1Q6NZL8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scube1Q6NZL8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scube1Q6NZL8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Scube1Q6NZL8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scube1Q6NZL8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scube1Q6NZL8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scube1Q6NZL8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scube1Q6NZL8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scube1Q6NZL8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scube1Q6NZL8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scube1Q6NZL8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scube1Q6NZL8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scube1Q6NZL8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scube1Q6NZL8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scube1Q6NZL8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scube1Q6NZL8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scube1Q6NZL8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scube1Q6NZL8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scube1Q6NZL8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scube1Q6NZL8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scube1Q6NZL8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scube1Q6NZL8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scube1Q6NZL8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scube1Q6NZL8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scube1Q6NZL8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scube1Q6NZL8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scube1Q6NZL8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scube1Q6NZL8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scube1Q6NZL8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scube1Q6NZL8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Scube1Q6NZL8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Scube1Q6NZL8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scube1Q6NZL8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms