Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NipblQ6KCD5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NipblQ6KCD5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NipblQ6KCD5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NipblQ6KCD5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NipblQ6KCD5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NipblQ6KCD5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NipblQ6KCD5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NipblQ6KCD5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NipblQ6KCD5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NipblQ6KCD5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NipblQ6KCD5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NipblQ6KCD5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NipblQ6KCD5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NipblQ6KCD5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NipblQ6KCD5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NipblQ6KCD5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NipblQ6KCD5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NipblQ6KCD5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NipblQ6KCD5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NipblQ6KCD5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NipblQ6KCD5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NipblQ6KCD5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NipblQ6KCD5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NipblQ6KCD5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NipblQ6KCD5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NipblQ6KCD5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NipblQ6KCD5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NipblQ6KCD5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NipblQ6KCD5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NipblQ6KCD5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NipblQ6KCD5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NipblQ6KCD5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NipblQ6KCD5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NipblQ6KCD5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NipblQ6KCD5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NipblQ6KCD5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NipblQ6KCD5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NipblQ6KCD5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NipblQ6KCD5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NipblQ6KCD5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NipblQ6KCD5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NipblQ6KCD5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NipblQ6KCD5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NipblQ6KCD5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NipblQ6KCD5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NipblQ6KCD5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NipblQ6KCD5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NipblQ6KCD5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NipblQ6KCD5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NipblQ6KCD5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NipblQ6KCD5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NipblQ6KCD5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NipblQ6KCD5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NipblQ6KCD5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NipblQ6KCD5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NipblQ6KCD5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NipblQ6KCD5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NipblQ6KCD5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NipblQ6KCD5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NipblQ6KCD5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NipblQ6KCD5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NipblQ6KCD5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NipblQ6KCD5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NipblQ6KCD5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NipblQ6KCD5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NipblQ6KCD5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NipblQ6KCD5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NipblQ6KCD5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NipblQ6KCD5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NipblQ6KCD5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NipblQ6KCD5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NipblQ6KCD5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NipblQ6KCD5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NipblQ6KCD5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NipblQ6KCD5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NipblQ6KCD5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NipblQ6KCD5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NipblQ6KCD5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NipblQ6KCD5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NipblQ6KCD5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NipblQ6KCD5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NipblQ6KCD5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NipblQ6KCD5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NipblQ6KCD5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NipblQ6KCD5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NipblQ6KCD5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NipblQ6KCD5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NipblQ6KCD5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NipblQ6KCD5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NipblQ6KCD5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NipblQ6KCD5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NipblQ6KCD5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NipblQ6KCD5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NipblQ6KCD5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NipblQ6KCD5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NipblQ6KCD5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NipblQ6KCD5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NipblQ6KCD5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NipblQ6KCD5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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