Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Arhgap20Q6IFT4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Arhgap20Q6IFT4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Arhgap20Q6IFT4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Arhgap20Q6IFT4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Arhgap20Q6IFT4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arhgap20Q6IFT4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Arhgap20Q6IFT4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Arhgap20Q6IFT4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Arhgap20Q6IFT4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Arhgap20Q6IFT4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Arhgap20Q6IFT4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Arhgap20Q6IFT4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arhgap20Q6IFT4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arhgap20Q6IFT4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Arhgap20Q6IFT4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Arhgap20Q6IFT4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arhgap20Q6IFT4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arhgap20Q6IFT4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Arhgap20Q6IFT4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Arhgap20Q6IFT4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Arhgap20Q6IFT4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arhgap20Q6IFT4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgap20Q6IFT4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Arhgap20Q6IFT4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Arhgap20Q6IFT4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Arhgap20Q6IFT4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Arhgap20Q6IFT4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Arhgap20Q6IFT4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Arhgap20Q6IFT4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Arhgap20Q6IFT4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Arhgap20Q6IFT4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Arhgap20Q6IFT4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Arhgap20Q6IFT4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Arhgap20Q6IFT4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Arhgap20Q6IFT4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Arhgap20Q6IFT4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Arhgap20Q6IFT4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Arhgap20Q6IFT4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Arhgap20Q6IFT4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Arhgap20Q6IFT4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Arhgap20Q6IFT4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Arhgap20Q6IFT4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Arhgap20Q6IFT4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Arhgap20Q6IFT4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Arhgap20Q6IFT4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Arhgap20Q6IFT4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Arhgap20Q6IFT4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Arhgap20Q6IFT4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Arhgap20Q6IFT4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Arhgap20Q6IFT4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Arhgap20Q6IFT4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Arhgap20Q6IFT4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Arhgap20Q6IFT4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Arhgap20Q6IFT4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Arhgap20Q6IFT4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arhgap20Q6IFT4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arhgap20Q6IFT4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arhgap20Q6IFT4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Arhgap20Q6IFT4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arhgap20Q6IFT4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arhgap20Q6IFT4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Arhgap20Q6IFT4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Arhgap20Q6IFT4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arhgap20Q6IFT4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Arhgap20Q6IFT4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgap20Q6IFT4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgap20Q6IFT4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arhgap20Q6IFT4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arhgap20Q6IFT4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgap20Q6IFT4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgap20Q6IFT4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgap20Q6IFT4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgap20Q6IFT4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgap20Q6IFT4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgap20Q6IFT4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgap20Q6IFT4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arhgap20Q6IFT4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arhgap20Q6IFT4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arhgap20Q6IFT4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Arhgap20Q6IFT4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arhgap20Q6IFT4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arhgap20Q6IFT4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Arhgap20Q6IFT4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arhgap20Q6IFT4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arhgap20Q6IFT4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arhgap20Q6IFT4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arhgap20Q6IFT4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arhgap20Q6IFT4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Arhgap20Q6IFT4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Arhgap20Q6IFT4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Arhgap20Q6IFT4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Arhgap20Q6IFT4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgap20Q6IFT4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgap20Q6IFT4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms