Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
Fgd6Q69ZL1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
Fgd6Q69ZL1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC45.65■■■■■ 4.9
Fgd6Q69ZL1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC45.56■■■■■ 4.88
Fgd6Q69ZL1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Fgd6Q69ZL1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
Fgd6Q69ZL1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Fgd6Q69ZL1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
Fgd6Q69ZL1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Fgd6Q69ZL1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
Fgd6Q69ZL1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
Fgd6Q69ZL1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC45.36■■■■■ 4.85
Fgd6Q69ZL1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
Fgd6Q69ZL1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
Fgd6Q69ZL1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Fgd6Q69ZL1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Fgd6Q69ZL1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
Fgd6Q69ZL1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Fgd6Q69ZL1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
Fgd6Q69ZL1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
Fgd6Q69ZL1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Fgd6Q69ZL1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC45.04■■■■■ 4.8
Fgd6Q69ZL1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Fgd6Q69ZL1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Fgd6Q69ZL1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
Fgd6Q69ZL1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
Fgd6Q69ZL1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Fgd6Q69ZL1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Fgd6Q69ZL1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Fgd6Q69ZL1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
Fgd6Q69ZL1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
Fgd6Q69ZL1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
Fgd6Q69ZL1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
Fgd6Q69ZL1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC44.69■■■■■ 4.75
Fgd6Q69ZL1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
Fgd6Q69ZL1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Fgd6Q69ZL1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Fgd6Q69ZL1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Fgd6Q69ZL1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
Fgd6Q69ZL1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Fgd6Q69ZL1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
Fgd6Q69ZL1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Fgd6Q69ZL1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
Fgd6Q69ZL1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Fgd6Q69ZL1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
Fgd6Q69ZL1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
Fgd6Q69ZL1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC44.32■■■■■ 4.69
Fgd6Q69ZL1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Fgd6Q69ZL1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
Fgd6Q69ZL1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
Fgd6Q69ZL1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
Fgd6Q69ZL1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Fgd6Q69ZL1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
Fgd6Q69ZL1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Fgd6Q69ZL1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Fgd6Q69ZL1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC44.11■■■■■ 4.65
Fgd6Q69ZL1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
Fgd6Q69ZL1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Fgd6Q69ZL1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Fgd6Q69ZL1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC44.02■■■■■ 4.64
Fgd6Q69ZL1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
Fgd6Q69ZL1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Fgd6Q69ZL1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Fgd6Q69ZL1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Fgd6Q69ZL1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Fgd6Q69ZL1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Fgd6Q69ZL1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Fgd6Q69ZL1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
Fgd6Q69ZL1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Fgd6Q69ZL1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Fgd6Q69ZL1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
Fgd6Q69ZL1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
Fgd6Q69ZL1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Fgd6Q69ZL1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Fgd6Q69ZL1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC43.79■■■■■ 4.6
Fgd6Q69ZL1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Fgd6Q69ZL1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Fgd6Q69ZL1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Fgd6Q69ZL1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Fgd6Q69ZL1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
Fgd6Q69ZL1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
Fgd6Q69ZL1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
Fgd6Q69ZL1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC43.66■■■■■ 4.58
Fgd6Q69ZL1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC43.65■■■■■ 4.58
Fgd6Q69ZL1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
Fgd6Q69ZL1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Fgd6Q69ZL1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Fgd6Q69ZL1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Fgd6Q69ZL1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Fgd6Q69ZL1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Fgd6Q69ZL1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Fgd6Q69ZL1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
Fgd6Q69ZL1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Fgd6Q69ZL1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Fgd6Q69ZL1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Fgd6Q69ZL1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Fgd6Q69ZL1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Fgd6Q69ZL1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Fgd6Q69ZL1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Fgd6Q69ZL1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms