Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Atg9aQ68FE2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
Atg9aQ68FE2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Atg9aQ68FE2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Atg9aQ68FE2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,27■■■■□ 3,08
Atg9aQ68FE2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Atg9aQ68FE2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Atg9aQ68FE2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34,2■■■■□ 3,07
Atg9aQ68FE2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,06
Atg9aQ68FE2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Atg9aQ68FE2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,19■■■■□ 3,06
Atg9aQ68FE2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Atg9aQ68FE2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,15■■■■□ 3,06
Atg9aQ68FE2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Atg9aQ68FE2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,1■■■■□ 3,05
Atg9aQ68FE2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Atg9aQ68FE2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Atg9aQ68FE2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Atg9aQ68FE2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Atg9aQ68FE2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Atg9aQ68FE2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33,91■■■■□ 3,02
Atg9aQ68FE2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Atg9aQ68FE2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Atg9aQ68FE2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Atg9aQ68FE2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,84■■■■□ 3,01
Atg9aQ68FE2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Atg9aQ68FE2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Atg9aQ68FE2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,75■■■□□ 2,99
Atg9aQ68FE2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Atg9aQ68FE2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Atg9aQ68FE2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,63■■■□□ 2,97
Atg9aQ68FE2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Atg9aQ68FE2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Atg9aQ68FE2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33,6■■■□□ 2,97
Atg9aQ68FE2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Atg9aQ68FE2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Atg9aQ68FE2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Atg9aQ68FE2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Atg9aQ68FE2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Atg9aQ68FE2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Atg9aQ68FE2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,44■■■□□ 2,94
Atg9aQ68FE2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Atg9aQ68FE2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Atg9aQ68FE2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Atg9aQ68FE2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Atg9aQ68FE2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,35■■■□□ 2,93
Atg9aQ68FE2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Atg9aQ68FE2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,35■■■□□ 2,93
Atg9aQ68FE2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Atg9aQ68FE2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Atg9aQ68FE2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Atg9aQ68FE2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Atg9aQ68FE2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33,29■■■□□ 2,92
Atg9aQ68FE2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33,23■■■□□ 2,91
Atg9aQ68FE2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Atg9aQ68FE2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Atg9aQ68FE2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Atg9aQ68FE2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Atg9aQ68FE2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Atg9aQ68FE2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,11■■■□□ 2,89
Atg9aQ68FE2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Atg9aQ68FE2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33,09■■■□□ 2,89
Atg9aQ68FE2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2,87
Atg9aQ68FE2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Atg9aQ68FE2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Atg9aQ68FE2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Atg9aQ68FE2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,89■■■□□ 2,86
Atg9aQ68FE2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Atg9aQ68FE2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Atg9aQ68FE2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Atg9aQ68FE2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Atg9aQ68FE2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Atg9aQ68FE2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Atg9aQ68FE2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Atg9aQ68FE2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Atg9aQ68FE2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Atg9aQ68FE2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Atg9aQ68FE2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Atg9aQ68FE2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,72■■■□□ 2,83
Atg9aQ68FE2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Atg9aQ68FE2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Atg9aQ68FE2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Atg9aQ68FE2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Atg9aQ68FE2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Atg9aQ68FE2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Atg9aQ68FE2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,59■■■□□ 2,81
Atg9aQ68FE2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Atg9aQ68FE2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Atg9aQ68FE2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Atg9aQ68FE2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Atg9aQ68FE2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Atg9aQ68FE2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Atg9aQ68FE2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Atg9aQ68FE2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Atg9aQ68FE2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Atg9aQ68FE2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Atg9aQ68FE2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Atg9aQ68FE2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Atg9aQ68FE2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,78
Atg9aQ68FE2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms