Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BC080695Q66JY9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC080695Q66JY9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BC080695Q66JY9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BC080695Q66JY9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BC080695Q66JY9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BC080695Q66JY9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC080695Q66JY9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BC080695Q66JY9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BC080695Q66JY9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BC080695Q66JY9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BC080695Q66JY9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BC080695Q66JY9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BC080695Q66JY9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BC080695Q66JY9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BC080695Q66JY9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BC080695Q66JY9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BC080695Q66JY9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BC080695Q66JY9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BC080695Q66JY9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BC080695Q66JY9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BC080695Q66JY9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BC080695Q66JY9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BC080695Q66JY9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BC080695Q66JY9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BC080695Q66JY9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BC080695Q66JY9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BC080695Q66JY9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC080695Q66JY9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BC080695Q66JY9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC080695Q66JY9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BC080695Q66JY9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BC080695Q66JY9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC080695Q66JY9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BC080695Q66JY9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BC080695Q66JY9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC080695Q66JY9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC080695Q66JY9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BC080695Q66JY9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BC080695Q66JY9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC080695Q66JY9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BC080695Q66JY9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC080695Q66JY9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC080695Q66JY9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC080695Q66JY9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC080695Q66JY9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BC080695Q66JY9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BC080695Q66JY9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BC080695Q66JY9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BC080695Q66JY9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BC080695Q66JY9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BC080695Q66JY9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BC080695Q66JY9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BC080695Q66JY9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BC080695Q66JY9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC080695Q66JY9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC080695Q66JY9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BC080695Q66JY9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BC080695Q66JY9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC080695Q66JY9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC080695Q66JY9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BC080695Q66JY9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BC080695Q66JY9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BC080695Q66JY9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BC080695Q66JY9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BC080695Q66JY9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BC080695Q66JY9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BC080695Q66JY9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BC080695Q66JY9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BC080695Q66JY9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BC080695Q66JY9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC080695Q66JY9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BC080695Q66JY9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BC080695Q66JY9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BC080695Q66JY9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC080695Q66JY9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BC080695Q66JY9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BC080695Q66JY9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC080695Q66JY9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BC080695Q66JY9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC080695Q66JY9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC080695Q66JY9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC080695Q66JY9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC080695Q66JY9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC080695Q66JY9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC080695Q66JY9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC080695Q66JY9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC080695Q66JY9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC080695Q66JY9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC080695Q66JY9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC080695Q66JY9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC080695Q66JY9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BC080695Q66JY9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BC080695Q66JY9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC080695Q66JY9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BC080695Q66JY9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC080695Q66JY9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC080695Q66JY9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BC080695Q66JY9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BC080695Q66JY9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.3 ms