Protein–RNA interactions for Protein: Q64522

Hist2h2ab, Histone H2A type 2-B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2abQ64522 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hist2h2abQ64522 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hist2h2abQ64522 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hist2h2abQ64522 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hist2h2abQ64522 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hist2h2abQ64522 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hist2h2abQ64522 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hist2h2abQ64522 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hist2h2abQ64522 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hist2h2abQ64522 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hist2h2abQ64522 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hist2h2abQ64522 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hist2h2abQ64522 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hist2h2abQ64522 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hist2h2abQ64522 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hist2h2abQ64522 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hist2h2abQ64522 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hist2h2abQ64522 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hist2h2abQ64522 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hist2h2abQ64522 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hist2h2abQ64522 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hist2h2abQ64522 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hist2h2abQ64522 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hist2h2abQ64522 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hist2h2abQ64522 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hist2h2abQ64522 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hist2h2abQ64522 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hist2h2abQ64522 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hist2h2abQ64522 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hist2h2abQ64522 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hist2h2abQ64522 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hist2h2abQ64522 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hist2h2abQ64522 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hist2h2abQ64522 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hist2h2abQ64522 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Hist2h2abQ64522 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Hist2h2abQ64522 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hist2h2abQ64522 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hist2h2abQ64522 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Hist2h2abQ64522 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hist2h2abQ64522 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hist2h2abQ64522 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hist2h2abQ64522 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hist2h2abQ64522 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hist2h2abQ64522 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hist2h2abQ64522 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hist2h2abQ64522 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hist2h2abQ64522 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hist2h2abQ64522 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hist2h2abQ64522 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hist2h2abQ64522 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hist2h2abQ64522 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hist2h2abQ64522 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hist2h2abQ64522 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hist2h2abQ64522 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hist2h2abQ64522 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hist2h2abQ64522 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hist2h2abQ64522 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hist2h2abQ64522 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hist2h2abQ64522 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hist2h2abQ64522 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hist2h2abQ64522 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hist2h2abQ64522 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hist2h2abQ64522 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hist2h2abQ64522 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hist2h2abQ64522 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hist2h2abQ64522 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hist2h2abQ64522 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hist2h2abQ64522 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hist2h2abQ64522 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hist2h2abQ64522 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hist2h2abQ64522 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hist2h2abQ64522 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hist2h2abQ64522 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hist2h2abQ64522 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hist2h2abQ64522 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hist2h2abQ64522 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hist2h2abQ64522 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hist2h2abQ64522 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hist2h2abQ64522 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hist2h2abQ64522 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hist2h2abQ64522 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hist2h2abQ64522 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hist2h2abQ64522 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hist2h2abQ64522 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hist2h2abQ64522 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hist2h2abQ64522 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hist2h2abQ64522 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hist2h2abQ64522 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hist2h2abQ64522 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hist2h2abQ64522 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hist2h2abQ64522 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hist2h2abQ64522 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Hist2h2abQ64522 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hist2h2abQ64522 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hist2h2abQ64522 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hist2h2abQ64522 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hist2h2abQ64522 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hist2h2abQ64522 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hist2h2abQ64522 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms