Protein–RNA interactions for Protein: Q64436

Atp4a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4aQ64436 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp4aQ64436 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp4aQ64436 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp4aQ64436 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp4aQ64436 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp4aQ64436 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp4aQ64436 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp4aQ64436 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp4aQ64436 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp4aQ64436 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp4aQ64436 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp4aQ64436 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp4aQ64436 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp4aQ64436 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp4aQ64436 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp4aQ64436 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp4aQ64436 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp4aQ64436 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp4aQ64436 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp4aQ64436 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp4aQ64436 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp4aQ64436 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp4aQ64436 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp4aQ64436 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp4aQ64436 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp4aQ64436 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp4aQ64436 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp4aQ64436 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp4aQ64436 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp4aQ64436 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp4aQ64436 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp4aQ64436 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp4aQ64436 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp4aQ64436 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp4aQ64436 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp4aQ64436 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp4aQ64436 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp4aQ64436 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp4aQ64436 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp4aQ64436 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp4aQ64436 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp4aQ64436 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp4aQ64436 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp4aQ64436 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp4aQ64436 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp4aQ64436 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp4aQ64436 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp4aQ64436 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp4aQ64436 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp4aQ64436 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp4aQ64436 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp4aQ64436 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp4aQ64436 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp4aQ64436 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp4aQ64436 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp4aQ64436 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp4aQ64436 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp4aQ64436 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp4aQ64436 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp4aQ64436 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp4aQ64436 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp4aQ64436 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp4aQ64436 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp4aQ64436 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp4aQ64436 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp4aQ64436 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp4aQ64436 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp4aQ64436 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp4aQ64436 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp4aQ64436 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp4aQ64436 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp4aQ64436 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp4aQ64436 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp4aQ64436 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp4aQ64436 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp4aQ64436 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp4aQ64436 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp4aQ64436 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp4aQ64436 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp4aQ64436 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp4aQ64436 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp4aQ64436 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Atp4aQ64436 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atp4aQ64436 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp4aQ64436 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp4aQ64436 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp4aQ64436 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp4aQ64436 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp4aQ64436 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp4aQ64436 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp4aQ64436 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp4aQ64436 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp4aQ64436 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp4aQ64436 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp4aQ64436 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp4aQ64436 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp4aQ64436 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp4aQ64436 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp4aQ64436 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp4aQ64436 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms