Protein–RNA interactions for Protein: Q64322

Npdc1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npdc1Q64322 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Npdc1Q64322 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Npdc1Q64322 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Npdc1Q64322 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Npdc1Q64322 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Npdc1Q64322 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Npdc1Q64322 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Npdc1Q64322 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Npdc1Q64322 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Npdc1Q64322 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Npdc1Q64322 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Npdc1Q64322 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Npdc1Q64322 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Npdc1Q64322 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npdc1Q64322 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Npdc1Q64322 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Npdc1Q64322 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Npdc1Q64322 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Npdc1Q64322 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Npdc1Q64322 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Npdc1Q64322 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Npdc1Q64322 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Npdc1Q64322 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Npdc1Q64322 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Npdc1Q64322 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Npdc1Q64322 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Npdc1Q64322 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Npdc1Q64322 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Npdc1Q64322 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Npdc1Q64322 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Npdc1Q64322 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Npdc1Q64322 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Npdc1Q64322 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Npdc1Q64322 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Npdc1Q64322 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Npdc1Q64322 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Npdc1Q64322 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Npdc1Q64322 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Npdc1Q64322 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npdc1Q64322 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npdc1Q64322 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Npdc1Q64322 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Npdc1Q64322 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Npdc1Q64322 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Npdc1Q64322 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Npdc1Q64322 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Npdc1Q64322 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Npdc1Q64322 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Npdc1Q64322 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Npdc1Q64322 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Npdc1Q64322 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Npdc1Q64322 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Npdc1Q64322 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Npdc1Q64322 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Npdc1Q64322 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npdc1Q64322 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Npdc1Q64322 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Npdc1Q64322 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Npdc1Q64322 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Npdc1Q64322 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Npdc1Q64322 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Npdc1Q64322 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Npdc1Q64322 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Npdc1Q64322 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Npdc1Q64322 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Npdc1Q64322 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Npdc1Q64322 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Npdc1Q64322 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Npdc1Q64322 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Npdc1Q64322 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Npdc1Q64322 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Npdc1Q64322 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Npdc1Q64322 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Npdc1Q64322 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Npdc1Q64322 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Npdc1Q64322 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Npdc1Q64322 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npdc1Q64322 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Npdc1Q64322 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Npdc1Q64322 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npdc1Q64322 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npdc1Q64322 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npdc1Q64322 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npdc1Q64322 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Npdc1Q64322 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npdc1Q64322 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Npdc1Q64322 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Npdc1Q64322 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Npdc1Q64322 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npdc1Q64322 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npdc1Q64322 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Npdc1Q64322 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npdc1Q64322 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Npdc1Q64322 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Npdc1Q64322 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Npdc1Q64322 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Npdc1Q64322 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Npdc1Q64322 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Npdc1Q64322 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npdc1Q64322 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms