Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CochQ62507 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CochQ62507 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CochQ62507 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CochQ62507 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CochQ62507 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CochQ62507 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CochQ62507 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CochQ62507 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CochQ62507 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CochQ62507 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CochQ62507 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CochQ62507 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CochQ62507 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CochQ62507 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CochQ62507 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CochQ62507 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CochQ62507 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CochQ62507 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CochQ62507 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CochQ62507 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CochQ62507 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CochQ62507 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CochQ62507 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CochQ62507 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CochQ62507 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CochQ62507 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CochQ62507 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CochQ62507 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CochQ62507 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CochQ62507 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CochQ62507 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CochQ62507 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CochQ62507 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CochQ62507 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CochQ62507 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CochQ62507 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CochQ62507 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CochQ62507 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CochQ62507 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CochQ62507 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CochQ62507 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CochQ62507 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CochQ62507 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CochQ62507 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CochQ62507 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CochQ62507 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CochQ62507 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CochQ62507 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CochQ62507 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CochQ62507 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CochQ62507 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CochQ62507 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CochQ62507 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CochQ62507 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CochQ62507 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CochQ62507 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CochQ62507 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CochQ62507 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CochQ62507 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CochQ62507 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CochQ62507 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CochQ62507 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CochQ62507 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CochQ62507 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CochQ62507 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CochQ62507 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CochQ62507 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CochQ62507 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CochQ62507 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CochQ62507 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CochQ62507 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CochQ62507 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CochQ62507 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CochQ62507 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CochQ62507 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CochQ62507 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CochQ62507 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CochQ62507 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CochQ62507 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CochQ62507 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CochQ62507 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CochQ62507 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CochQ62507 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CochQ62507 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CochQ62507 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CochQ62507 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CochQ62507 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CochQ62507 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CochQ62507 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CochQ62507 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CochQ62507 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CochQ62507 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CochQ62507 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CochQ62507 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CochQ62507 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CochQ62507 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CochQ62507 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CochQ62507 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CochQ62507 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms