Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Supt6hQ62383 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Supt6hQ62383 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Supt6hQ62383 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Supt6hQ62383 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Supt6hQ62383 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Supt6hQ62383 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
Supt6hQ62383 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC42■■■■■ 4.31
Supt6hQ62383 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Supt6hQ62383 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
Supt6hQ62383 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Supt6hQ62383 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
Supt6hQ62383 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Supt6hQ62383 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.3
Supt6hQ62383 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Supt6hQ62383 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Supt6hQ62383 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Supt6hQ62383 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Supt6hQ62383 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Supt6hQ62383 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Supt6hQ62383 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Supt6hQ62383 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Supt6hQ62383 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Supt6hQ62383 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
Supt6hQ62383 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Supt6hQ62383 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Supt6hQ62383 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC41.57■■■■■ 4.24
Supt6hQ62383 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Supt6hQ62383 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Supt6hQ62383 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Supt6hQ62383 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Supt6hQ62383 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Supt6hQ62383 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Supt6hQ62383 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
Supt6hQ62383 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Supt6hQ62383 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
Supt6hQ62383 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Supt6hQ62383 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Supt6hQ62383 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Supt6hQ62383 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Supt6hQ62383 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Supt6hQ62383 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Supt6hQ62383 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Supt6hQ62383 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Supt6hQ62383 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Supt6hQ62383 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Supt6hQ62383 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
Supt6hQ62383 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Supt6hQ62383 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Supt6hQ62383 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Supt6hQ62383 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Supt6hQ62383 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
Supt6hQ62383 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Supt6hQ62383 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
Supt6hQ62383 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Supt6hQ62383 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Supt6hQ62383 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Supt6hQ62383 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Supt6hQ62383 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Supt6hQ62383 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Supt6hQ62383 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Supt6hQ62383 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Supt6hQ62383 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Supt6hQ62383 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Supt6hQ62383 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Supt6hQ62383 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Supt6hQ62383 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Supt6hQ62383 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Supt6hQ62383 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Supt6hQ62383 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
Supt6hQ62383 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Supt6hQ62383 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Supt6hQ62383 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Supt6hQ62383 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
Supt6hQ62383 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Supt6hQ62383 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Supt6hQ62383 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Supt6hQ62383 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Supt6hQ62383 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Supt6hQ62383 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Supt6hQ62383 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Supt6hQ62383 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Supt6hQ62383 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Supt6hQ62383 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Supt6hQ62383 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Supt6hQ62383 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Supt6hQ62383 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Supt6hQ62383 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Supt6hQ62383 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Supt6hQ62383 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Supt6hQ62383 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Supt6hQ62383 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Supt6hQ62383 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Supt6hQ62383 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Supt6hQ62383 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Supt6hQ62383 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Supt6hQ62383 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Supt6hQ62383 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC40.03■■■■■ 4
Supt6hQ62383 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Supt6hQ62383 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms