Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spock1Q62288 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spock1Q62288 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Spock1Q62288 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Spock1Q62288 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spock1Q62288 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spock1Q62288 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spock1Q62288 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spock1Q62288 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spock1Q62288 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spock1Q62288 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spock1Q62288 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spock1Q62288 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spock1Q62288 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spock1Q62288 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spock1Q62288 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spock1Q62288 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spock1Q62288 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spock1Q62288 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spock1Q62288 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Spock1Q62288 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spock1Q62288 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spock1Q62288 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spock1Q62288 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spock1Q62288 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spock1Q62288 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spock1Q62288 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spock1Q62288 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spock1Q62288 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spock1Q62288 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spock1Q62288 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Spock1Q62288 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spock1Q62288 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spock1Q62288 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spock1Q62288 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spock1Q62288 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spock1Q62288 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spock1Q62288 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spock1Q62288 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spock1Q62288 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spock1Q62288 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spock1Q62288 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spock1Q62288 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spock1Q62288 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spock1Q62288 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spock1Q62288 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spock1Q62288 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Spock1Q62288 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spock1Q62288 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spock1Q62288 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spock1Q62288 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spock1Q62288 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Spock1Q62288 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spock1Q62288 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spock1Q62288 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spock1Q62288 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spock1Q62288 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Spock1Q62288 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spock1Q62288 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spock1Q62288 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spock1Q62288 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spock1Q62288 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spock1Q62288 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spock1Q62288 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spock1Q62288 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Spock1Q62288 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spock1Q62288 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Spock1Q62288 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spock1Q62288 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spock1Q62288 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spock1Q62288 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spock1Q62288 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spock1Q62288 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spock1Q62288 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spock1Q62288 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spock1Q62288 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spock1Q62288 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spock1Q62288 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spock1Q62288 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spock1Q62288 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spock1Q62288 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spock1Q62288 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spock1Q62288 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spock1Q62288 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spock1Q62288 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spock1Q62288 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Spock1Q62288 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spock1Q62288 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spock1Q62288 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spock1Q62288 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spock1Q62288 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spock1Q62288 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spock1Q62288 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spock1Q62288 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spock1Q62288 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spock1Q62288 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spock1Q62288 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spock1Q62288 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spock1Q62288 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spock1Q62288 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms