Protein–RNA interactions for Protein: Q62247

Sox16, Protein SOX-16 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox16Q62247 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox16Q62247 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox16Q62247 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox16Q62247 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox16Q62247 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox16Q62247 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox16Q62247 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox16Q62247 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox16Q62247 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox16Q62247 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox16Q62247 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox16Q62247 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox16Q62247 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox16Q62247 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox16Q62247 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox16Q62247 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox16Q62247 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox16Q62247 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox16Q62247 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox16Q62247 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox16Q62247 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox16Q62247 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox16Q62247 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox16Q62247 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox16Q62247 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox16Q62247 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox16Q62247 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox16Q62247 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox16Q62247 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox16Q62247 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox16Q62247 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox16Q62247 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox16Q62247 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox16Q62247 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox16Q62247 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox16Q62247 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox16Q62247 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox16Q62247 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox16Q62247 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox16Q62247 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox16Q62247 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox16Q62247 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox16Q62247 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox16Q62247 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox16Q62247 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox16Q62247 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox16Q62247 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox16Q62247 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox16Q62247 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox16Q62247 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox16Q62247 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox16Q62247 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox16Q62247 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox16Q62247 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox16Q62247 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox16Q62247 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox16Q62247 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox16Q62247 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox16Q62247 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox16Q62247 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox16Q62247 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox16Q62247 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox16Q62247 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox16Q62247 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox16Q62247 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox16Q62247 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox16Q62247 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox16Q62247 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox16Q62247 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox16Q62247 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox16Q62247 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox16Q62247 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox16Q62247 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox16Q62247 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox16Q62247 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox16Q62247 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox16Q62247 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox16Q62247 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox16Q62247 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox16Q62247 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox16Q62247 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox16Q62247 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox16Q62247 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox16Q62247 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox16Q62247 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox16Q62247 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox16Q62247 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox16Q62247 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox16Q62247 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox16Q62247 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox16Q62247 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox16Q62247 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox16Q62247 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox16Q62247 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox16Q62247 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox16Q62247 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox16Q62247 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sox16Q62247 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox16Q62247 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox16Q62247 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms