Protein–RNA interactions for Protein: Q62230

Siglec1, Sialoadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siglec1Q62230 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Siglec1Q62230 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Siglec1Q62230 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Siglec1Q62230 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Siglec1Q62230 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Siglec1Q62230 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Siglec1Q62230 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Siglec1Q62230 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Siglec1Q62230 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Siglec1Q62230 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Siglec1Q62230 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Siglec1Q62230 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Siglec1Q62230 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Siglec1Q62230 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Siglec1Q62230 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Siglec1Q62230 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Siglec1Q62230 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Siglec1Q62230 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Siglec1Q62230 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Siglec1Q62230 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Siglec1Q62230 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Siglec1Q62230 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Siglec1Q62230 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Siglec1Q62230 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Siglec1Q62230 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Siglec1Q62230 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Siglec1Q62230 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Siglec1Q62230 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Siglec1Q62230 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Siglec1Q62230 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Siglec1Q62230 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Siglec1Q62230 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Siglec1Q62230 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Siglec1Q62230 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Siglec1Q62230 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Siglec1Q62230 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Siglec1Q62230 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Siglec1Q62230 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Siglec1Q62230 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Siglec1Q62230 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Siglec1Q62230 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Siglec1Q62230 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Siglec1Q62230 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Siglec1Q62230 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Siglec1Q62230 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Siglec1Q62230 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Siglec1Q62230 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Siglec1Q62230 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Siglec1Q62230 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Siglec1Q62230 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Siglec1Q62230 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Siglec1Q62230 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Siglec1Q62230 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Siglec1Q62230 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Siglec1Q62230 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Siglec1Q62230 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Siglec1Q62230 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Siglec1Q62230 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Siglec1Q62230 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Siglec1Q62230 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Siglec1Q62230 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Siglec1Q62230 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Siglec1Q62230 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Siglec1Q62230 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Siglec1Q62230 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Siglec1Q62230 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Siglec1Q62230 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Siglec1Q62230 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Siglec1Q62230 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Siglec1Q62230 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Siglec1Q62230 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Siglec1Q62230 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Siglec1Q62230 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Siglec1Q62230 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Siglec1Q62230 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Siglec1Q62230 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Siglec1Q62230 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Siglec1Q62230 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Siglec1Q62230 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Siglec1Q62230 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Siglec1Q62230 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Siglec1Q62230 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Siglec1Q62230 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Siglec1Q62230 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Siglec1Q62230 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Siglec1Q62230 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Siglec1Q62230 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Siglec1Q62230 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Siglec1Q62230 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Siglec1Q62230 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Siglec1Q62230 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Siglec1Q62230 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Siglec1Q62230 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Siglec1Q62230 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Siglec1Q62230 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Siglec1Q62230 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Siglec1Q62230 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Siglec1Q62230 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Siglec1Q62230 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Siglec1Q62230 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms