Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Tgfb1i1Q62219 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Tgfb1i1Q62219 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Tgfb1i1Q62219 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Tgfb1i1Q62219 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Tgfb1i1Q62219 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Tgfb1i1Q62219 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Tgfb1i1Q62219 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Tgfb1i1Q62219 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Tgfb1i1Q62219 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Tgfb1i1Q62219 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Tgfb1i1Q62219 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tgfb1i1Q62219 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tgfb1i1Q62219 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tgfb1i1Q62219 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Tgfb1i1Q62219 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Tgfb1i1Q62219 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Tgfb1i1Q62219 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Tgfb1i1Q62219 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Tgfb1i1Q62219 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Tgfb1i1Q62219 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tgfb1i1Q62219 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Tgfb1i1Q62219 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Tgfb1i1Q62219 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Tgfb1i1Q62219 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Tgfb1i1Q62219 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Tgfb1i1Q62219 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Tgfb1i1Q62219 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Tgfb1i1Q62219 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Tgfb1i1Q62219 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Tgfb1i1Q62219 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Tgfb1i1Q62219 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Tgfb1i1Q62219 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Tgfb1i1Q62219 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Tgfb1i1Q62219 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Tgfb1i1Q62219 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Tgfb1i1Q62219 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Tgfb1i1Q62219 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Tgfb1i1Q62219 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Tgfb1i1Q62219 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Tgfb1i1Q62219 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Tgfb1i1Q62219 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Tgfb1i1Q62219 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Tgfb1i1Q62219 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Tgfb1i1Q62219 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Tgfb1i1Q62219 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Tgfb1i1Q62219 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Tgfb1i1Q62219 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Tgfb1i1Q62219 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Tgfb1i1Q62219 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Tgfb1i1Q62219 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Tgfb1i1Q62219 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Tgfb1i1Q62219 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Tgfb1i1Q62219 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Tgfb1i1Q62219 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Tgfb1i1Q62219 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Tgfb1i1Q62219 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Tgfb1i1Q62219 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Tgfb1i1Q62219 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Tgfb1i1Q62219 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Tgfb1i1Q62219 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Tgfb1i1Q62219 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Tgfb1i1Q62219 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Tgfb1i1Q62219 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Tgfb1i1Q62219 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Tgfb1i1Q62219 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Tgfb1i1Q62219 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Tgfb1i1Q62219 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Tgfb1i1Q62219 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Tgfb1i1Q62219 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tgfb1i1Q62219 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tgfb1i1Q62219 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tgfb1i1Q62219 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Tgfb1i1Q62219 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Tgfb1i1Q62219 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Tgfb1i1Q62219 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Tgfb1i1Q62219 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tgfb1i1Q62219 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tgfb1i1Q62219 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tgfb1i1Q62219 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Tgfb1i1Q62219 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Tgfb1i1Q62219 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Tgfb1i1Q62219 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Tgfb1i1Q62219 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tgfb1i1Q62219 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tgfb1i1Q62219 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tgfb1i1Q62219 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Tgfb1i1Q62219 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Tgfb1i1Q62219 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Tgfb1i1Q62219 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Tgfb1i1Q62219 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tgfb1i1Q62219 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Tgfb1i1Q62219 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Tgfb1i1Q62219 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Tgfb1i1Q62219 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Tgfb1i1Q62219 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Tgfb1i1Q62219 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Tgfb1i1Q62219 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Tgfb1i1Q62219 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tgfb1i1Q62219 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms