Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sycp1Q62209 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sycp1Q62209 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sycp1Q62209 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sycp1Q62209 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sycp1Q62209 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sycp1Q62209 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Sycp1Q62209 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sycp1Q62209 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sycp1Q62209 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sycp1Q62209 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sycp1Q62209 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sycp1Q62209 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sycp1Q62209 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sycp1Q62209 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Sycp1Q62209 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sycp1Q62209 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sycp1Q62209 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sycp1Q62209 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sycp1Q62209 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sycp1Q62209 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sycp1Q62209 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sycp1Q62209 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sycp1Q62209 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sycp1Q62209 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sycp1Q62209 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sycp1Q62209 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sycp1Q62209 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sycp1Q62209 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sycp1Q62209 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Sycp1Q62209 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sycp1Q62209 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sycp1Q62209 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sycp1Q62209 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sycp1Q62209 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Sycp1Q62209 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sycp1Q62209 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sycp1Q62209 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sycp1Q62209 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sycp1Q62209 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sycp1Q62209 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sycp1Q62209 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Sycp1Q62209 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Sycp1Q62209 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sycp1Q62209 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sycp1Q62209 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sycp1Q62209 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sycp1Q62209 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Sycp1Q62209 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sycp1Q62209 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sycp1Q62209 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sycp1Q62209 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sycp1Q62209 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Sycp1Q62209 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Sycp1Q62209 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sycp1Q62209 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sycp1Q62209 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sycp1Q62209 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sycp1Q62209 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sycp1Q62209 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sycp1Q62209 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sycp1Q62209 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sycp1Q62209 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Sycp1Q62209 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Sycp1Q62209 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sycp1Q62209 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sycp1Q62209 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sycp1Q62209 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sycp1Q62209 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sycp1Q62209 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sycp1Q62209 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sycp1Q62209 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sycp1Q62209 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sycp1Q62209 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sycp1Q62209 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sycp1Q62209 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sycp1Q62209 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sycp1Q62209 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sycp1Q62209 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sycp1Q62209 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sycp1Q62209 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sycp1Q62209 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sycp1Q62209 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sycp1Q62209 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Sycp1Q62209 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sycp1Q62209 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Sycp1Q62209 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sycp1Q62209 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sycp1Q62209 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sycp1Q62209 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sycp1Q62209 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sycp1Q62209 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sycp1Q62209 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sycp1Q62209 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp1Q62209 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sycp1Q62209 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sycp1Q62209 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sycp1Q62209 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sycp1Q62209 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sycp1Q62209 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms