Protein–RNA interactions for Protein: Q62052

Oca2, P protein, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oca2Q62052 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Oca2Q62052 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Oca2Q62052 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Oca2Q62052 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Oca2Q62052 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Oca2Q62052 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Oca2Q62052 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Oca2Q62052 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Oca2Q62052 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Oca2Q62052 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Oca2Q62052 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Oca2Q62052 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Oca2Q62052 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Oca2Q62052 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Oca2Q62052 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Oca2Q62052 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Oca2Q62052 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Oca2Q62052 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Oca2Q62052 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Oca2Q62052 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Oca2Q62052 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Oca2Q62052 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Oca2Q62052 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Oca2Q62052 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Oca2Q62052 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Oca2Q62052 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Oca2Q62052 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Oca2Q62052 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Oca2Q62052 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Oca2Q62052 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Oca2Q62052 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Oca2Q62052 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Oca2Q62052 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Oca2Q62052 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Oca2Q62052 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Oca2Q62052 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Oca2Q62052 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Oca2Q62052 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Oca2Q62052 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Oca2Q62052 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Oca2Q62052 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Oca2Q62052 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Oca2Q62052 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Oca2Q62052 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Oca2Q62052 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Oca2Q62052 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Oca2Q62052 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Oca2Q62052 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Oca2Q62052 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Oca2Q62052 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Oca2Q62052 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Oca2Q62052 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Oca2Q62052 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Oca2Q62052 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Oca2Q62052 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Oca2Q62052 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Oca2Q62052 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Oca2Q62052 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Oca2Q62052 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Oca2Q62052 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Oca2Q62052 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Oca2Q62052 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Oca2Q62052 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Oca2Q62052 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Oca2Q62052 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Oca2Q62052 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Oca2Q62052 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Oca2Q62052 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Oca2Q62052 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Oca2Q62052 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Oca2Q62052 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Oca2Q62052 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Oca2Q62052 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Oca2Q62052 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Oca2Q62052 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Oca2Q62052 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Oca2Q62052 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Oca2Q62052 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Oca2Q62052 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Oca2Q62052 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Oca2Q62052 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Oca2Q62052 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Oca2Q62052 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Oca2Q62052 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Oca2Q62052 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Oca2Q62052 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Oca2Q62052 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Oca2Q62052 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Oca2Q62052 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Oca2Q62052 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Oca2Q62052 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Oca2Q62052 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Oca2Q62052 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Oca2Q62052 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Oca2Q62052 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Oca2Q62052 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Oca2Q62052 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Oca2Q62052 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Oca2Q62052 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Oca2Q62052 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms