Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
AtrxQ61687 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
AtrxQ61687 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
AtrxQ61687 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
AtrxQ61687 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
AtrxQ61687 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
AtrxQ61687 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
AtrxQ61687 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
AtrxQ61687 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
AtrxQ61687 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
AtrxQ61687 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
AtrxQ61687 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
AtrxQ61687 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
AtrxQ61687 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
AtrxQ61687 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
AtrxQ61687 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25,65■■□□□ 1,7
AtrxQ61687 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
AtrxQ61687 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
AtrxQ61687 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,57■■□□□ 1,68
AtrxQ61687 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,57■■□□□ 1,68
AtrxQ61687 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
AtrxQ61687 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
AtrxQ61687 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
AtrxQ61687 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
AtrxQ61687 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
AtrxQ61687 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
AtrxQ61687 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,44■■□□□ 1,66
AtrxQ61687 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
AtrxQ61687 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
AtrxQ61687 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
AtrxQ61687 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,38■■□□□ 1,65
AtrxQ61687 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
AtrxQ61687 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
AtrxQ61687 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
AtrxQ61687 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
AtrxQ61687 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
AtrxQ61687 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
AtrxQ61687 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
AtrxQ61687 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
AtrxQ61687 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
AtrxQ61687 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
AtrxQ61687 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
AtrxQ61687 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
AtrxQ61687 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
AtrxQ61687 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
AtrxQ61687 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
AtrxQ61687 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
AtrxQ61687 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
AtrxQ61687 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
AtrxQ61687 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
AtrxQ61687 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
AtrxQ61687 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
AtrxQ61687 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
AtrxQ61687 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
AtrxQ61687 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,06■■□□□ 1,6
AtrxQ61687 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,04■■□□□ 1,6
AtrxQ61687 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
AtrxQ61687 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1,59
AtrxQ61687 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,98■■□□□ 1,59
AtrxQ61687 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24,97■■□□□ 1,59
AtrxQ61687 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
AtrxQ61687 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24,96■■□□□ 1,59
AtrxQ61687 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24,95■■□□□ 1,58
AtrxQ61687 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24,94■■□□□ 1,58
AtrxQ61687 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
AtrxQ61687 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24,92■■□□□ 1,58
AtrxQ61687 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
AtrxQ61687 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24,91■■□□□ 1,58
AtrxQ61687 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
AtrxQ61687 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
AtrxQ61687 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24,88■■□□□ 1,57
AtrxQ61687 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
AtrxQ61687 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
AtrxQ61687 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
AtrxQ61687 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
AtrxQ61687 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
AtrxQ61687 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
AtrxQ61687 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
AtrxQ61687 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24,81■■□□□ 1,56
AtrxQ61687 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
AtrxQ61687 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,78■■□□□ 1,56
AtrxQ61687 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
AtrxQ61687 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
AtrxQ61687 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
AtrxQ61687 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
AtrxQ61687 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
AtrxQ61687 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
AtrxQ61687 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24,73■■□□□ 1,55
AtrxQ61687 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24,71■■□□□ 1,55
AtrxQ61687 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
AtrxQ61687 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
AtrxQ61687 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
AtrxQ61687 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
AtrxQ61687 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24,66■■□□□ 1,54
AtrxQ61687 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24,64■■□□□ 1,53
AtrxQ61687 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
AtrxQ61687 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
AtrxQ61687 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
AtrxQ61687 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
AtrxQ61687 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,8 ms