Protein–RNA interactions for Protein: Q61206

Pafah1b2, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b2Q61206 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pafah1b2Q61206 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pafah1b2Q61206 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pafah1b2Q61206 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pafah1b2Q61206 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pafah1b2Q61206 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pafah1b2Q61206 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pafah1b2Q61206 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pafah1b2Q61206 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pafah1b2Q61206 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pafah1b2Q61206 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pafah1b2Q61206 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pafah1b2Q61206 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pafah1b2Q61206 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pafah1b2Q61206 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pafah1b2Q61206 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pafah1b2Q61206 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pafah1b2Q61206 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pafah1b2Q61206 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pafah1b2Q61206 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pafah1b2Q61206 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pafah1b2Q61206 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pafah1b2Q61206 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pafah1b2Q61206 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pafah1b2Q61206 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pafah1b2Q61206 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pafah1b2Q61206 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pafah1b2Q61206 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pafah1b2Q61206 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pafah1b2Q61206 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pafah1b2Q61206 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pafah1b2Q61206 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pafah1b2Q61206 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pafah1b2Q61206 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pafah1b2Q61206 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pafah1b2Q61206 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pafah1b2Q61206 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pafah1b2Q61206 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pafah1b2Q61206 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pafah1b2Q61206 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pafah1b2Q61206 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pafah1b2Q61206 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pafah1b2Q61206 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pafah1b2Q61206 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pafah1b2Q61206 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pafah1b2Q61206 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pafah1b2Q61206 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pafah1b2Q61206 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pafah1b2Q61206 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pafah1b2Q61206 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pafah1b2Q61206 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Pafah1b2Q61206 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pafah1b2Q61206 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pafah1b2Q61206 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pafah1b2Q61206 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pafah1b2Q61206 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pafah1b2Q61206 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pafah1b2Q61206 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pafah1b2Q61206 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pafah1b2Q61206 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pafah1b2Q61206 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pafah1b2Q61206 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pafah1b2Q61206 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pafah1b2Q61206 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pafah1b2Q61206 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pafah1b2Q61206 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pafah1b2Q61206 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pafah1b2Q61206 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pafah1b2Q61206 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pafah1b2Q61206 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pafah1b2Q61206 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pafah1b2Q61206 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pafah1b2Q61206 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pafah1b2Q61206 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pafah1b2Q61206 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pafah1b2Q61206 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pafah1b2Q61206 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pafah1b2Q61206 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pafah1b2Q61206 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pafah1b2Q61206 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pafah1b2Q61206 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pafah1b2Q61206 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pafah1b2Q61206 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pafah1b2Q61206 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pafah1b2Q61206 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pafah1b2Q61206 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pafah1b2Q61206 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pafah1b2Q61206 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pafah1b2Q61206 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pafah1b2Q61206 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pafah1b2Q61206 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pafah1b2Q61206 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pafah1b2Q61206 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pafah1b2Q61206 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pafah1b2Q61206 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pafah1b2Q61206 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pafah1b2Q61206 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pafah1b2Q61206 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pafah1b2Q61206 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pafah1b2Q61206 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms