Protein–RNA interactions for Protein: Q61093

Cybb, Cytochrome b-245 heavy chain, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CybbQ61093 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CybbQ61093 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CybbQ61093 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CybbQ61093 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CybbQ61093 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CybbQ61093 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CybbQ61093 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CybbQ61093 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CybbQ61093 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CybbQ61093 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CybbQ61093 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CybbQ61093 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CybbQ61093 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CybbQ61093 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CybbQ61093 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CybbQ61093 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CybbQ61093 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CybbQ61093 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CybbQ61093 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CybbQ61093 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CybbQ61093 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CybbQ61093 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CybbQ61093 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CybbQ61093 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CybbQ61093 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CybbQ61093 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CybbQ61093 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CybbQ61093 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CybbQ61093 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CybbQ61093 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CybbQ61093 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CybbQ61093 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CybbQ61093 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CybbQ61093 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CybbQ61093 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CybbQ61093 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CybbQ61093 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CybbQ61093 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CybbQ61093 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CybbQ61093 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CybbQ61093 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CybbQ61093 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CybbQ61093 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CybbQ61093 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CybbQ61093 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CybbQ61093 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CybbQ61093 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CybbQ61093 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CybbQ61093 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CybbQ61093 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CybbQ61093 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CybbQ61093 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CybbQ61093 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CybbQ61093 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CybbQ61093 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CybbQ61093 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CybbQ61093 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CybbQ61093 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CybbQ61093 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CybbQ61093 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CybbQ61093 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CybbQ61093 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CybbQ61093 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CybbQ61093 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CybbQ61093 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CybbQ61093 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CybbQ61093 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CybbQ61093 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CybbQ61093 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CybbQ61093 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CybbQ61093 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CybbQ61093 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CybbQ61093 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CybbQ61093 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CybbQ61093 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CybbQ61093 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CybbQ61093 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CybbQ61093 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CybbQ61093 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CybbQ61093 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CybbQ61093 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CybbQ61093 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CybbQ61093 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CybbQ61093 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CybbQ61093 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CybbQ61093 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CybbQ61093 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CybbQ61093 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CybbQ61093 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CybbQ61093 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CybbQ61093 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CybbQ61093 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CybbQ61093 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CybbQ61093 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CybbQ61093 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CybbQ61093 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CybbQ61093 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CybbQ61093 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CybbQ61093 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CybbQ61093 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms