Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35,12■■■■□ 3,21
HellsQ60848 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35,09■■■■□ 3,21
HellsQ60848 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35,07■■■■□ 3,2
HellsQ60848 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
HellsQ60848 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,02■■■■□ 3,2
HellsQ60848 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
HellsQ60848 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
HellsQ60848 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34,96■■■■□ 3,19
HellsQ60848 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,93■■■■□ 3,18
HellsQ60848 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
HellsQ60848 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
HellsQ60848 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,9■■■■□ 3,18
HellsQ60848 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,89■■■■□ 3,18
HellsQ60848 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
HellsQ60848 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
HellsQ60848 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
HellsQ60848 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
HellsQ60848 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
HellsQ60848 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,74■■■■□ 3,15
HellsQ60848 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,72■■■■□ 3,15
HellsQ60848 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34,63■■■■□ 3,13
HellsQ60848 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
HellsQ60848 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,58■■■■□ 3,13
HellsQ60848 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
HellsQ60848 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
HellsQ60848 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,5■■■■□ 3,11
HellsQ60848 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
HellsQ60848 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
HellsQ60848 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,37■■■■□ 3,09
HellsQ60848 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34,37■■■■□ 3,09
HellsQ60848 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
HellsQ60848 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,35■■■■□ 3,09
HellsQ60848 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,35■■■■□ 3,09
HellsQ60848 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,35■■■■□ 3,09
HellsQ60848 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
HellsQ60848 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
HellsQ60848 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
HellsQ60848 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,3■■■■□ 3,08
HellsQ60848 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
HellsQ60848 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
HellsQ60848 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,2■■■■□ 3,07
HellsQ60848 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,14■■■■□ 3,06
HellsQ60848 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
HellsQ60848 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,13■■■■□ 3,05
HellsQ60848 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
HellsQ60848 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,09■■■■□ 3,05
HellsQ60848 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
HellsQ60848 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34,07■■■■□ 3,04
HellsQ60848 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
HellsQ60848 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
HellsQ60848 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
HellsQ60848 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
HellsQ60848 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33,96■■■■□ 3,03
HellsQ60848 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
HellsQ60848 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
HellsQ60848 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,88■■■■□ 3,01
HellsQ60848 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,87■■■■□ 3,01
HellsQ60848 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
HellsQ60848 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
HellsQ60848 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
HellsQ60848 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
HellsQ60848 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33,76■■■□□ 2,99
HellsQ60848 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33,74■■■□□ 2,99
HellsQ60848 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
HellsQ60848 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
HellsQ60848 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
HellsQ60848 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
HellsQ60848 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33,61■■■□□ 2,97
HellsQ60848 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,58■■■□□ 2,97
HellsQ60848 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
HellsQ60848 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
HellsQ60848 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
HellsQ60848 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
HellsQ60848 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
HellsQ60848 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
HellsQ60848 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
HellsQ60848 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33,48■■■□□ 2,95
HellsQ60848 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
HellsQ60848 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
HellsQ60848 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
HellsQ60848 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
HellsQ60848 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
HellsQ60848 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
HellsQ60848 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
HellsQ60848 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
HellsQ60848 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
HellsQ60848 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,33■■■□□ 2,93
HellsQ60848 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
HellsQ60848 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
HellsQ60848 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
HellsQ60848 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
HellsQ60848 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33,24■■■□□ 2,91
HellsQ60848 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
HellsQ60848 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
HellsQ60848 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
HellsQ60848 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
HellsQ60848 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33,19■■■□□ 2,9
HellsQ60848 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
HellsQ60848 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
HellsQ60848 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,9 ms