Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cldn11Q60771 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cldn11Q60771 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cldn11Q60771 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cldn11Q60771 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cldn11Q60771 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cldn11Q60771 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cldn11Q60771 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cldn11Q60771 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cldn11Q60771 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cldn11Q60771 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cldn11Q60771 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cldn11Q60771 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cldn11Q60771 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Cldn11Q60771 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cldn11Q60771 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cldn11Q60771 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cldn11Q60771 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cldn11Q60771 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cldn11Q60771 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cldn11Q60771 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cldn11Q60771 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Cldn11Q60771 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cldn11Q60771 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cldn11Q60771 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cldn11Q60771 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cldn11Q60771 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cldn11Q60771 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cldn11Q60771 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cldn11Q60771 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cldn11Q60771 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cldn11Q60771 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cldn11Q60771 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cldn11Q60771 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cldn11Q60771 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cldn11Q60771 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cldn11Q60771 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cldn11Q60771 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cldn11Q60771 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cldn11Q60771 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cldn11Q60771 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cldn11Q60771 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cldn11Q60771 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cldn11Q60771 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cldn11Q60771 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cldn11Q60771 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cldn11Q60771 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cldn11Q60771 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cldn11Q60771 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cldn11Q60771 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cldn11Q60771 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cldn11Q60771 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cldn11Q60771 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cldn11Q60771 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cldn11Q60771 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cldn11Q60771 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cldn11Q60771 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cldn11Q60771 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cldn11Q60771 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cldn11Q60771 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cldn11Q60771 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cldn11Q60771 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cldn11Q60771 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cldn11Q60771 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cldn11Q60771 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cldn11Q60771 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cldn11Q60771 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cldn11Q60771 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cldn11Q60771 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cldn11Q60771 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cldn11Q60771 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cldn11Q60771 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cldn11Q60771 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cldn11Q60771 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cldn11Q60771 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cldn11Q60771 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cldn11Q60771 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cldn11Q60771 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cldn11Q60771 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cldn11Q60771 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cldn11Q60771 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cldn11Q60771 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cldn11Q60771 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cldn11Q60771 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cldn11Q60771 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cldn11Q60771 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cldn11Q60771 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cldn11Q60771 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cldn11Q60771 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cldn11Q60771 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cldn11Q60771 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cldn11Q60771 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cldn11Q60771 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cldn11Q60771 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cldn11Q60771 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cldn11Q60771 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cldn11Q60771 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cldn11Q60771 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cldn11Q60771 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cldn11Q60771 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms